SF3B2

SF3B2
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, Cus1, SAP145, SF3B145, SF3b1, SF3b150, splitsningsfaktor 3b subenhet 2, CFM
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Splicing factor 3B subenhet 2 är ett protein som hos människor kodas av SF3B2 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för subenhet 2 av splitsningsfaktor 3b-proteinkomplexet. Splitsningsfaktor 3b, tillsammans med splitsningsfaktor 3a och en 12S RNA-enhet, bildar U2 små nukleära ribonukleoproteinkomplex (U2 snRNP). Splitsningsfaktor 3b/3a-komplexet binder pre-mRNA uppströms om intronets grenställe på ett sekvensoberoende sätt och kan förankra U2 snRNP till pre-mRNA. Splitsningsfaktor 3b är också en komponent i den mindre U12-typ spliceosomen. Subenhet 2 associerar med pre-mRNA uppströms om förgreningsstället vid förankringsstället. Subenhet 2 interagerar också direkt med subenhet 4 i splitsningsfaktor 3b-komplexet. Subenhet 2 är ett mycket hydrofilt protein med en prolinrik N-terminal och en glutamatrik sträcka i C-terminalen.

Interaktioner

SF3B2 har visats interagera med SF3B4 , RBM7 , SF3B1 och CDC5L .

Vidare läsning

Agell N, Aligué R, Alemany V, Castro A, Jaime M, Pujol MJ, Rius E, Serratosa J, Taulés M, Bachs O (1998). "Nya nukleära funktioner för calmodulin". Cellkalcium . 23 (2–3): 115–21. doi : 10.1016/S0143-4160(98)90109-9 . PMID 9601606 .
Champion-Arnaud P, Reed R (aug 1994). "Prespliceosomkomponenterna SAP 49 och SAP 145 interagerar i ett komplex som är inblandat i att koppla U2 snRNP till grenplatsen" . Gener & utveckling . 8 (16): 1974–83. doi : 10.1101/gad.8.16.1974 . PMID 7958871 .
Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (sep 1998). "Masspektrometri och EST-databassökning möjliggör karakterisering av multi-protein spliceosomkomplexet". Naturgenetik . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
Das BK, Xia L, Palandjian L, Gozani O, Chyung Y, Reed R (okt 1999). "Karakterisering av ett proteinkomplex som innehåller spliceosomala proteiner SAPs 49, 130, 145 och 155" . Molekylär och cellulär biologi . 19 (10): 6796–802. doi : 10.1128/mcb.19.10.6796 . PMC 84676 . PMID 10490618 .
Das R, Zhou Z, Reed R (maj 2000). "Funktionell association av U2 snRNP med det ATP-oberoende spliceosomala komplexet E" . Molekylär cell . 5 (5): 779–87. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80318-4 . PMID 10882114 .
Bryant HE, Wadd SE, Lamond AI, Silverstein SJ, Clements JB (maj 2001). "Herpes simplex virus IE63 (ICP27) protein interagerar med spliceosom-associerat protein 145 och hämmar splitsning före det första katalytiska steget" . Journal of Virology . 75 (9): 4376–85. doi : 10.1128/JVI.75.9.4376-4385.2001 . PMC 114182 . PMID 11287586 .
Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (juni 2001). "UV-skadat DNA-bindande protein i TFTC-komplexet kopplar DNA-skada igenkänning till nukleosomacetylering" . EMBO Journal . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (aug 2001). "Ett nytt U2- och U11/U12-snRNP-protein som associerar med pre-mRNA-grenstället" . EMBO Journal . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (april 2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (sep 2002). "Karakterisering av nya SF3b- och 17S U2 snRNP-proteiner, inklusive en human Prp5p-homolog och ett SF3b DEAD-box-protein" . EMBO Journal . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
Warner DR, Roberts EA, Greene RM, Pisano MM (dec 2003). "Identifiering av nya Smad-bindande proteiner". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 312 (4): 1185–90. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.11.049 . PMID 14651998 .
Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (juni 2004). "Human 18S U11/U12 snRNP innehåller en uppsättning nya proteiner som inte finns i den U2-beroende spliceosomen" . RNA . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (aug 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Lin KT, Lu RM, Tarn WY (okt 2004). "De WW-domäninnehållande proteinerna interagerar med den tidiga spliceosomen och deltar i pre-mRNA-splitsning in vivo" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (20): 9176–85. doi : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (Jan 2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (okt 2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Ardon O, Zimmerman ES, Andersen JL, DeHart JL, Blackett J, Planelles V (april 2006). "Induktion av G2-stopp och bindning till cyklofilin A är oberoende fenotyper av humant immunbristvirus typ 1 Vpr" . Journal of Virology . 80 (8): 3694–700. doi : 10.1128/JVI.80.8.3694-3700.2006 . PMC 1440437 . PMID 16571786 .