Transkriptionsförlängningsregulator 1

TCERG1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CA150, TAF2S, Urn1, transkriptionsförlängningsregulator 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Transkriptionsförlängningsregulator 1 , även känd som TCERG1 , är ett protein som hos människor kodas av TCERG1 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för ett nukleärt protein som reglerar transkriptionell förlängning och pre- mRNA-splitsning . Det kodade proteinet interagerar med den hyperfosforylerade C-terminala domänen av RNA-polymeras II via flera FF-domäner och med pre-mRNA-splitsningsfaktorn SF1 via en WW-domän. Alternativ splitsning resulterar i flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Interaktioner

Transkriptionsförlängningsregulator 1 har visats interagera med SF1 och POLR2A .

Vidare läsning

•    Suñé C, Hayashi T, Liu Y, et al. (1997). "CA150, ett nukleärt protein associerat med RNA-polymeras II-holoenzymet, är involverat i Tat-aktiverat humant immunbristvirus typ 1-transkription. " Mol. Cell. Biol . 17 (10): 6029–39. doi : 10.1128/MCB.17.10.6029 . PMC 232452 . PMID 9315662 .
•    Neubauer G, King A, Rappsilber J, et al. (1998). "Masspektrometri och EST-databassökning möjliggör karakterisering av multi-protein spliceosomkomplexet". Nat. Genet . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
•    Suñé C, Garcia-Blanco MA (1999). "Transkriptionskofaktor CA150 reglerar RNA-polymeras II-förlängning på ett TATA-box-beroende sätt" . Mol. Cell. Biol . 19 (7): 4719–28. doi : 10.1128/MCB.19.7.4719 . PMC 84270 . PMID 10373521 .
•    Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C, et al. (2000). "Protein-interaktionsmoduler som organiserar nukleär funktion: FF-domäner av CA150 binder fosfoCTD av RNA-polymeras II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (16): 9015–20. Bibcode : 2000PNAS...97.9015C . doi : 10.1073/pnas.160266597 . PMC 16813 . PMID 10908677 .
•    Bohne J, Cole SE, Sune C, et al. (2000). "Expressionsanalys och kartläggning av musen och den mänskliga transkriptionsregulatorn CA150". Mamma. Genom . 11 (10): 930–3. doi : 10.1007/s003350010162 . PMID 11003711 . S2CID 2396234 .
•    Holbert S, Denghien I, Kiechle T, et al. (2001). "Gln-Ala-repeterande transkriptionsaktivatorn CA150 interagerar med huntingtin: neuropatologiska och genetiska bevis för en roll i patogenesen av Huntingtons sjukdom. " Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (4): 1811–6. doi : 10.1073/pnas.041566798 . PMC 29339 . PMID 11172033 .
•    Goldstrohm AC, Albrecht TR, Suñé C, et al. (2001). "Transkriptionsförlängningsfaktorn CA150 interagerar med RNA-polymeras II och pre-mRNA-splitsningsfaktorn SF1" . Mol. Cell. Biol . 21 (22): 7617–28. doi : 10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001 . PMC 99933 . PMID 11604498 .
•    Zhou Z, Licklider LJ, Gygi SP, Reed R (2002). "Omfattande proteomisk analys av den mänskliga spliceosomen". Naturen . 419 (6903): 182–5. Bibcode : 2002Natur.419..182Z . doi : 10.1038/nature01031 . PMID 12226669 . S2CID 4372405 .
•   Carty SM, Greenleaf AL (2003). "Hyperfosforylerade C-terminala upprepade domänassocierande proteiner i det nukleära proteomet länkar transkription till DNA/kromatinmodifiering och RNA-bearbetning" . Mol. Cell. Proteomik . 1 (8): 598–610. doi : 10.1074/mcp.M200029-MCP200 . PMID 12376575 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Chattopadhyay B, Ghosh S, Gangopadhyay PK, et al. (2003). "Modulation av ålder vid debut i Huntingtons sjukdom och patienter med spinocerebellär ataxi typ 2 härstammar från östra Indien". Neurosci. Lett . 345 (2): 93–6. doi : 10.1016/S0304-3940(03)00436-1 . PMID 12821179 . S2CID 33727221 .
•   Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, et al. (2003). "Jäst två-hybridskärmar innebär involvering av Fanconi-anemiproteiner i transkriptionsreglering, cellsignalering, oxidativ metabolism och cellulär transport". Exp. Cell Res . 289 (2): 211–21. doi : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . PMID 14499622 .
•   Palancade B, Marshall NF, Tremeau-Bravard A, et al. (2004). "Defosforylering av RNA-polymeras II av CTD-fosfatas FCP1 hämmas av fosfo-CTD-associerande proteiner". J. Mol. Biol . 335 (2): 415–24. doi : 10.1016/j.jmb.2003.10.036 . PMID 14672652 .
•    Nagel JE, Smith RJ, Shaw L, et al. (2005). "Identifiering av gener differentiellt uttryckta i T-celler efter stimulering med kemokinerna CXCL12 och CXCL10" . BMC Immunol . 5 : 17. doi : 10.1186/1471-2172-5-17 . PMC 514893 . PMID 15296517 .
•   Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, et al. (2004). "Ett proteininteraktionsnätverk länkar GIT1, en förstärkare av huntingtinaggregation, till Huntingtons sjukdom" . Mol. Cell . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276 .
•    Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). "De WW-domäninnehållande proteinerna interagerar med den tidiga spliceosomen och deltar i pre-mRNA-splitsning in vivo" . Mol. Cell. Biol . 24 (20): 9176–85. doi : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .
•    Smith MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). "FF-domäner av CA150 binder transkriptions- och splitsningsfaktorer genom flera svaga interaktioner" . Mol. Cell. Biol . 24 (21): 9274–85. doi : 10.1128/MCB.24.21.9274-9285.2004 . PMC 522232 . PMID 15485897 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
•   McFie PJ, Wang GL, Timchenko NA, et al. (2006). "Identifiering av en co-repressor som hämmar transkriptions- och tillväxthämningsaktiviteterna av CCAAT/enhancer-bindande protein alfa" . J. Biol. Chem . 281 (26): 18069–80. doi : 10.1074/jbc.M512734200 . PMID 16644732 .