RprA RNA
| RprA RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av RprA-
| |
| identifierare | |
| Symbol | RprA |
| Rfam | RF00034 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000387 |
| PDB- strukturer | PDBe |
RprA -RNA -genen kodar för ett 106 nukleotiders regulatoriskt icke-kodande RNA . Translationell reglering av sigmafaktorn RpoS i stationär fas förmedlas genom bildandet av en dubbelsträngad RNA -stamslingastruktur i uppströmsregionen av rpoS -budbärar-RNA:t, vilket blockerar translationsinitieringsstället.
Kloner som bär rprA (RpoS regulator RNA A) ökade translationen av RpoS. Som med DsrA förutsägs RprA bilda tre stamslingor. Således deltar minst två små RNA, DsrA och RprA, i den positiva regleringen av RpoS translation. RprA verkar också binda till RpoS-ledaren. RprA är icke väsentligt. Wasserman et al. visade att detta RNA är bundet av Hfq-proteinet . Bindning till Hfq ändrar konformationen av RprA. I närvaro av Hfq påverkas stabiliteten av RprA av cellens osmolaritet , detta är beroende av endoribonukleaset RNase E .
Det har visat sig att RprA reglerar de proteinkodande generna, kallade csgD , detta protein kodar för en stationär fasinducerad biofilmregulator och ydaM, som kodar för ett diguanylatcyklas som är involverat i att aktivera csgD-transkription. Dessa två målgener undertrycks av RprA vilket resulterar i reglering av biofilmbildning .