CsgD

CsgD är ett transkriptions- och svarsregulatorprotein som refereras till som mastermodulatorn för utveckling av bakteriell biofilm . I E. coli- celler har CsgD till uppgift att hjälpa till vid övergången från planktonisk cellmotilitet till den stationära fasen av biofilmbildning, som svar på miljötillväxtfaktorer. En transkriptionsanalysanalys (som sker in vitro ) illustrerade en ökad minskning av CsgD:s DNA-bindningskapacitet när den fosforylerades vid AA D59 av proteinets primära sekvens . Därför, i proteinets aktiva form (ofosforylerad), kan CsgD utföra sina normala funktioner för att reglera curli- proteiner ( fimbria ) och producera ECM- polysackarider ( cellulosa ). Efter en promotor- lacZ- fusionsanalys av CsgD-bindning till specifika målställen på E. colis genom, identifierades två klasser av bindande mål: grupp I-gener och grupp II-gener . Grupp I-generna, besläktade med fliE och yhbT , uppvisar undertryckt transkription efter deras interaktion med CsgD, medan grupp II-gener , inklusive yccT och adrA , illustrerade aktiv funktionalitet. Andra grupp I- operoner som illustrerar undertryckt transkription inkluderar fliE och fliEFGH, för motil flagellbildning. Andra grupp II-gener, som är absolut nödvändiga för övergången till stationär biofilmutveckling, inkluderar csgBA , som kodar för curli fimbriae, och adrA , som kodar för syntesen av cykliskt diguanylat . I detta sammanhang fungerar c-di-GMP som en bakteriell sekundär budbärare, vilket ökar produktionen av extracellulär cellulosa och hindrar flagellumproduktion och rotation.