Ribonukleoproteinpartikel
En ribonukleoproteinpartikel eller RNP är vesikelkomplex som bildas mellan RNA och RNA-bindande proteiner ( RBP). Termen RNP-foci kan också användas för att beteckna intracellulära avdelningar som är involverade i bearbetning av RNA- transkript .
RNA/RBP-komplex
RBP interagerar med RNA genom olika strukturella motiv. Aromatiska aminosyrarester i RNA-bindande proteiner resulterar i staplingsinteraktioner med RNA. Lysinrester i den spiralformade delen av RNA-bindande proteiner hjälper till att stabilisera interaktioner med andra nukleinsyror som ett resultat av attraktionskraften mellan de positivt laddade lysinsidokedjorna och den negativt laddade fosfat- "ryggraden" i RNA.
Det antas att RNA-sekvenser i den 3'-otranslaterade regionen bestämmer bindningen av RBP och att dessa RBP bestämmer det post-transkriptionella ödet för mRNA.
RNP granulat
RNP-granulat är en mycket mångsidig grupp av fack. Dessa inkluderar stressgranulat , bearbetningskroppar och exosomer i somatiska celler . Många RNP-granuler är celltyps- och/eller artspecifika. Till exempel finns kromatoidkroppar endast i manliga könsceller, medan transportgranuler hittills endast har hittats i neuroner och oocyter . RNP-granuler fungerar huvudsakligen genom att fysiskt separera eller associera transkript med proteiner. De fungerar i lagring, bearbetning, nedbrytning och transport av deras tillhörande transkript.
RNP-granuler har visat sig ha särskild betydelse i celler där post-transkriptionell reglering är av vital betydelse. Till exempel i neuroner där transkript måste transporteras och lagras i dendriter för bildande och förstärkning av kopplingar, i oocyter/embryon där mRNA lagras i åratal innan de översätts, och i utvecklande spermieceller där transkriptionen stoppas innan utvecklingen är klar.
Se även
- Messenger RNP : komplex mellan mRNA och protein(er) närvarande i kärnan
- Heterogen ribonukleoproteinpartikel : komplex av RNA och protein som finns i cellkärnan