Repressor lexA
| LexA DNA-bindande domän | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 lexa s119a
| |||||||||
| mutantidentifierare | |||||||||
| Symbol | LexA_DNA_bind | ||||||||
| Pfam | PF01726 | ||||||||
| Pfam klan | CL0123 | ||||||||
| InterPro | IPR006199 | ||||||||
| SCOP2 | 1leb / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Repressor LexA eller LexA är en transkriptionsrepressor ( EC 3.4.21.88 ) som undertrycker SOS-responsgener som kodar primärt för felbenägna DNA-polymeraser , DNA- reparationsenzymer och celldelningshämmare . LexA bildar de facto ett tvåkomponents regulatoriskt system med RecA , som känner av DNA-skador vid avstannade replikationsgafflar, bildar monofilament och förvärvar en aktiv konformation som kan binda till LexA och få LexA att klyva sig själv, i en process som kallas autoproteolys .
DNA-skador kan orsakas av antibiotika , bakteriofager och UV-ljus . Av potentiellt kliniskt intresse är induktionen av SOS-svaret av antibiotika, såsom ciprofloxacin . Bakterier kräver topoisomeraser såsom DNA-gyras eller topoisomeras IV för DNA-replikation . Antibiotika som ciprofloxacin kan förhindra verkan av dessa molekyler genom att fästa sig till gyrat-DNA-komplexet, vilket leder till replikationsgaffelstopp och induktion av SOS-svaret. Uttrycket av felbenägna polymeraser under SOS-svaret ökar basalmutationshastigheten hos bakterier. Även om mutationer ofta är dödliga för cellen, kan de också förbättra överlevnaden. I det specifika fallet med topoisomeraser har vissa bakterier muterat en av sina aminosyror så att ciprofloxacinet bara kan skapa en svag bindning till topoisomeraset. Detta är en av de metoder som bakterier använder för att bli resistenta mot antibiotika. Ciprofloxacinbehandling kan därför potentiellt leda till generering av mutationer som kan göra bakterier resistenta mot ciprofloxacin. Dessutom har ciprofloxacin också visat sig inducera via SOS-svaret spridning av virulensfaktorer och antibiotikaresistensdeterminanter , såväl som aktiveringen av integronintegreser , vilket potentiellt ökar sannolikheten för förvärv och spridning av antibiotikaresistens av bakterier.
Nedsatt LexA-proteolys har visats störa ciprofloxacinresistens. Detta erbjuder potential för kombinationsterapi som kombinerar kinoloner med strategier som syftar till att störa verkan av LexA, antingen direkt eller via RecA.
LexA innehåller en DNA- bindande domän . Det bevingade HTH-motivet av LexA är en variant av det helix-turn-helix- DNA-bindande motivet , och det är vanligtvis beläget vid proteinets N-terminal .
