RNA-ligas (ATP)

Identifierare
för RNA-ligas (ATP).
EG nr. 6.5.1.3
CAS-nr. 37353-39-2
Databaser
IntEnz IntEnz-vy
BRENDA BRENDA inträde
ExPASy NiceZyme-vy
KEGG KEGG inträde
MetaCyc Metabolisk väg
PRIAM profil
PDB- strukturer RCSB PDB PDBe PDB summa
Genontologi AmiGO / QuickGO
Sök
PMC artiklar
PubMed artiklar
NCBI proteiner

Inom enzymologi är ett RNA-ligas (ATP) ( EC 6.5.1.3 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen

ATP + (ribonukleotid)n + (ribonukleotid)m AMP + difosfat + (ribonukleotid)n + m

De tre substraten för detta enzym är ATP , (ribonukleotid)n och (ribonukleotid)m, medan dess tre produkter är AMP , difosfat och (ribonukleotid)n+m.

Detta enzym tillhör familjen ligaser , speciellt de som bildar fosforsyraesterbindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är poly(ribonukleotid):poly(ribonukleotid)ligas (AMP-bildande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar polyribonukleotidsyntas (ATP) , RNA-ligas , polyribonukleotidligas och ribonukleotidligas .

Strukturstudier

I slutet av 2007 har två strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1VDX och 2C5U .

  •    Silber R, Malathi VG, Hurwitz J (1972). "Rening och egenskaper hos bakteriofag T4-inducerat RNA-ligas" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 69 (10): 3009–13. Bibcode : 1972PNAS...69.3009S . doi : 10.1073/pnas.69.10.3009 . PMC 389696 . PMID 4342972 .