Rabaptin
| Rabaptin | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Kristallografisk struktur av den C-terminala Rabaptin5 -domänen homodimer (färgad orange och magenta i mitten av figuren) komplexbunden med två oberoende molekyler av GTPase -domänen av RAB5A (regnbågsfärgad, N-terminal = blå, C-terminal = röd) .
| |||||||||||
| Identifierare | |||||||||||
| Symbol | Rabaptin | ||||||||||
| Pfam | PF03528 | ||||||||||
| InterPro | IPR003914 | ||||||||||
| |||||||||||
Rabaptin är ett nyckelprotein involverat i regenerering av skadade axoner .
Regenerering av skadade axoner vid neuromuskulära korsningar regleras av extracellulära proteinfaktorer som främjar neuritutväxt . En ny neuritutväxtfaktor från kycklingdenerverad skelettmuskel har klonats och karakteriserats. Proteinet, kallat neurocrescin (rabaptin), har visat sig utsöndras på ett aktivitetsberoende sätt.
Rabaptin är ett 100 kDa coiled-coil- protein som interagerar med GTP-formen av det lilla GTPaset Rab5 (se RAB5A , RAB5B , RAB5C ), en potent regulator av endocytisk transport. Det är huvudsakligen cytosoliskt, men en del samlokaliserar med Rab5 till tidiga endosomer . Rab5 rekryterar rabaptin-5 till renade tidiga endosomer på ett GTP-beroende sätt, vilket visar funktionella likheter med andra medlemmar av Ras-familjen . Immunutarmning av rabaptin-5 från cytosol hämmar kraftigt Rab5-beroende tidig endosommembranfusion . Således är rabaptin-5 en Rab-effektor som krävs för membrandockning och fusion.
Rab5 bidrar till tidig endosomfusion som fungerar genom koordineringen av andra effektorproteiner, som nämnts ovan. Rabaptinkomponenter kan tjäna till att kontrollera SNARE-aktiviteten som är avgörande vid membranfusion.
Strukturera
En kristallstruktur för GTPas- domänen av RAB5A komplexbunden med den C-terminala domänen av Rabaptin5 har bestämts. De två proteinerna bildar ett symmetriskt RAB5A-Rabaptin5 ternärt komplex med en parallell spolad Rabaptin5 homodimer i mitten komplexbunden med två molekyler av Rabaptin5, en på varje sida (se figuren till höger).
Mänskliga proteiner
RABEP1 ; RABEP2;