ProteoWizard
| Initial release | 14 mars 2008 |
|---|---|
| Stabil frisättning | 3.0 |
| Förvar | |
| Skrivet i | C++ , C# |
| Operativ system | Windows , (partiellt stöd för OS X och Linux ) |
| Typ | för bioinformatik / masspektrometri |
| Licens | Apache-licens 2.0 |
| Hemsida |
ProteoWizard är en uppsättning med öppen källkod, plattformsoberoende verktyg och bibliotek för proteomikdataanalyser. Det tillhandahåller ett ramverk för enhetlig masspektrometridatafilåtkomst och utför standardkemi- och LCMS-datauppsättningsberäkningar. Specifikt kan den läsa många av de leverantörsspecifika, proprietära formaten och konvertera data till ett öppet dataformat.
På applikationsnivå tillhandahåller programvaran körbara filer för datakonvertering (msConvert, msConvertGUI och idConvert), datavisualisering (msPicture och seeMS), dataåtkomst (msAccess, msCat, idCat och msPicture), dataanalys (peekaboo och msPrefix14) och grundläggande proteomics verktyg (motorsåg). Dessutom är projektet även värd för Skyline-mjukvaran som hjälper till att skapa, förvärva och analysera riktade proteomikexperiment som SRM -experiment.
De huvudsakliga bidragsgivarna till projektet är Tabb, MacCoss och Mallicks forskningslabb samt Insilicos.
Se även
- ^ Kessner, D.; Chambers, M.; Burke, R.; Agus, D.; Mallick, P. (november 2008). "ProteoWizard: programvara med öppen källkod för snabb utveckling av proteomikverktyg" . Bioinformatik . 24 (21): 2534–6. doi : 10.1093/bioinformatics/btn323 . PMC 2732273 . PMID 18606607 .
- ^ Chambers MC.; Maclean, B.; Burke, R.; Amodei, D.; Ruderman, DL.; Neumann, S.; Gatto, L.; Fischer, B.; et al. (okt 2012). "En plattformsoberoende verktygslåda för masspektrometri och proteomik" . Nat Biotechnol . 30 (10): 918–20. doi : 10.1038/nbt.2377 . PMC 3471674 . PMID 23051804 .
- ^ ProteoWizard: Team