Pegivirus
| Pegivirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Kitrinoviricota |
| Klass: | Flasuviricetes |
| Beställa: | Amarillovirales |
| Familj: | Flaviviridae |
| Släkte: | Pegivirus |
| Art | |
|
|
|
Pegivirus är det godkända namnet för ett släkte av enkla positivsträngade RNA-virus i familjen Flaviviridae . Namnet är härlett: "Pe" står för "persistent" och "g" är en referens till Hepatit G , ett tidigare namn på C -arten.
Taxonomi
Elva namngivna arter är inom släktet Pegivirus . Isolat som tillhör arten Pegivirus C är monofyletiska och visar < 50 % nukleotidsekvens (55 % aminosyra) sekvensdivergens mellan inriktade sekvenser från polyproteinet från varandra. Alla skiljer sig dock med >50% nukleotid (>55% aminosyra) divergens från andra medlemmar av detta släkte. Pegivirus som tilldelats denna art ( Pegivirus A ) kommer från primatvärdarter (människor, schimpanser och flera nya världens apaarter). Sekvensen U22303 har tilldelats som typmedlem av arten, eftersom detta var det första pegiviruset som beskrevs för denna art. Terminologi för att beskriva virus med olika värdar har inte godkänts av International Committee on Taxonomy of Viruses; dock Pegivirus A- virus kallats HPgV för humant pegivirus, SPgV för pegivirus från nya världen och SPgVcpz för schimpans-apevirus. [ citat behövs ]
En andra art inom pegivirusen kallas Pegivirus B. Endast ett virus ingick i namnförslaget, vilket var ett komplett genom av ett virus som finns i fladdermusarten Pteropus giganteus . Denna sekvens skiljer sig med >50 % nukleotid (>55 % aminosyra) divergens från alla föreslagna medlemmar av de primathärledda Pegivirus C -arterna som härstammar från primatvärdarter (människor, schimpanser och flera nya världens apaarter). Sekvensen GU566734 har tilldelats som typmedlem av arten, eftersom detta var det första pegiviruset som beskrevs för denna art. [ citat behövs ]
Användningen av djupsekvenseringsteknologier har identifierat ytterligare virus som skiljer sig från Pegivirus B -arter med >50 % nukleotid (>55 % aminosyra) och Pegivirus C i gnagare, hästar och i olika fladdermusarter, och apor från gamla världen och antalet Pegivirusarter har utökats till elva.
Reviderad taxonomi
Arterna kända 2016 har sedan dess klassificerats i 11 arter – Pegivirus A–K.
- Pegivirus A inkluderar viruset GBV-A
- Pegivirus B inkluderar viruset GBV-D
- Pegivirus C inkluderar viruset GBV-C
- Pegivirus D inkluderar viruset Theilers sjukdom associerat virus
- Pegivirus E inkluderar viruset Equine pegivirus
- Pegivirus F inkluderar viruset Bat pegivirus
- Pegivirus G inkluderar viruset Bat pegivirus
- Pegivirus H inkluderar viruset Humant pegivirus 2
- Pegivirus I inkluderar viruset Bat pegivirus
- Pegivirus J inkluderar viruset Gnagarpegivirus
- Pegivirus K inkluderar viruset Porcint pegivirus
Historia
- rapporterades experimentell ympning av serum från en trettiofyraårig kirurg (George Barker) med akut hepatit till tamariner ha resulterat i hepatit .
- 1995 identifierades två nya medlemmar av familjen Flaviviridae (GBV-A och GBV-B) i tamariner som utvecklade hepatit efter inokulering med den 11:e GB-passagen. Ett antal GBV-A-varianter identifierades senare i vilda nya världens apor som fångades.
- Därefter, 1995, identifierades ett humant virus [GBV-C eller hepatit G-virus (HGV)].
- Ett mer avlägset besläktat virus (GBV-D) upptäcktes senare i fladdermusen ( Pteropus giganteus ) .
- Släktet Pegivirus föreslogs 2011. GBV-B tilldelades släktet Hepacivirus , medan GBV-A tillsammans med GBV-C tilldelades det nya släktet Pegivirus .
- Under 2016 delades Pegivirus- släktet in i 11 arter – pegivirus A–K med GBV-C klassificerade under pegivirus C-arter.
Anteckningar
- Theilers sjukdom - en form av hästhepatit - verkar också orsakas av ett pegivirus - Theilers sjukdom associerat virus .
- Humant hepegivirus 1 eller Humant Pegivirus 2 (HPgV2) är ett virus isolerat från två multipeltransfunderade blödarsjuka och två transfunderade patienter. Detta virus verkar tillhöra en ny grupp av Pegivirus.
- Ett besläktat virus har isolerats från den graciösa katthajen ( Proscyllium habereri) .
- De mänskliga pegivirusen verkar vara besläktade med den icke-mänskliga primatarten.
- Forskare 2019 beskrev Humant pegivirus-1 som en "orsak till mänsklig encefalit (Leukoencefalit)"; samt sexuellt och mor-till-barn överförbara.
- Ett annat virus – gnagare-pegavirus – har isolerats från vitstrupen ( Neotoma albigula) .
- Ett pegivirus (equine pegivirus) har också isolerats från en häst.