HPgV-2

Pegivirus H
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Kitrinoviricota
Klass:	Flasuviricetes
Beställa:	Amarillovirales
Familj:	Flaviviridae
Släkte:	Pegivirus
Arter:	Pegivirus H

HPgV-2 (även känt som humant pegivirus typ 2 ) är det andra mänskliga pegiviruset som upptäckts. Det identifierades första gången 2005 i blod från transfusionsmottagare och fick ursprungligen namnet hepegivirus 1 eftersom det delade vissa genetiska egenskaper med både pegivirus och hepacivirus . HPgV-2 upptäcktes senare oberoende av en annan grupp i blodet hos en HCV-infekterad patient som hade genomgått flera blodtransfusioner och dog av sepsis av oklar etiologi. Det fick då namnet humant pegivirus 2 . HPgV-2 klassificeras nu i pegivirussläktet som en del av Pegivirus H -arter.

HPgV-2 är ett blodburet virus som orsakar kroniska långtidsinfektioner ungefär som hepatit C-virus (HCV) och GB-virus C (HPgV) – det första mänskliga pegiviruset som har upptäckts – men är inte känt för att vara associerat med någon sjukdom. Det infekterar vanligtvis personer som redan är infekterade av HCV och har en prevalens runt 1–2 % hos sådana personer. Dess prevalens hos HCV/ hiv- saminfekterade personer är fortfarande högre – upp till 10 %. Dess prevalens i den allmänna befolkningen i Kina och USA är dock mycket låg, 0,1–0,2 %. Den kroniska infektionen av HPgV-2 upprätthålls i närvaro av antihölje-antikroppar, vilket är fallet för HCV-kroniska infektioner, medan i fallet med GB-virus C , uppkomsten av antikroppar vanligtvis leder till upplösning av infektionen.

HPgV-2 är ett enkelsträngat RNA-virus med positiv sens med en genomlängd på cirka 9 800 nukleotider. Dess genomiska organisation liknar den hos andra flavivirus . Det producerar ett enda polyprotein översatt från en enda öppen läsram , som sedan klyvs av det virala proteaset till flera virala proteiner: två strukturella höljesglykoproteiner ( E1 och E2), sex icke-strukturella proteiner (NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A, och NS5B), ett trunkerat kärnprotein (S, nukleokapsid ) och ett X-protein med okänd funktion. Olika stammar av HPgV-2 har sekvenshomologi på 90 % eller mer.