parstabilitetsdeterminant
| FstAT | |
|---|---|
 Sekundär struktur för FstAT-
| |
| identifierare | |
| Symbol | fstAT |
| Rfam | RF01797 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; antitoxin |
| Domän(er) | Enterococcus faecalis |
| PDB- strukturer | PDBe |
| toxin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| -antitoxinsystemidentifierare | |||||||||
| Symbol | Fst_toxin | ||||||||
| Pfam | PF13955 | ||||||||
| TCDB | 1.C.64 | ||||||||
| OPM superfamilj | 225 | ||||||||
| OPM-protein | 2kv5 | ||||||||
| |||||||||
Par - stabilitetsdeterminanten är ett 400 bp- lokus av pAD1 -plasmiden som kodar för ett typ I-toxin-antitoxinsystem i Enterococcus faecalis . Det var den första sådan plasmidberoendemodul som hittades i grampositiva bakterier .
Par - locuset innehåller två gener : fst som kodar för ett 33- aminosyror toxiskt protein och en gen för RNAII, det lilla RNA-antitoxinet som hämmar första translation . De två generna finns på motsatta DNA- strängar och delar en 5'- region som är där de tros ha en antisens -interaktion. Deras sekundära RNA-strukturer har förutspåtts beräkningsmässigt , de komplementära regionerna verkar presenteras på exponerade slingor för interaktion.
par upprätthåller pAD1 med hjälp av post-segregational killing (PSK). Om en dottercell inte ärver par locus, kommer det instabila RNAII snabbt att brytas ned och lämna kvar det långlivade fst-toxinet för att skada eller döda dottercellen .
Se även
Vidare läsning
- Gerdes K, Gultyaev AP, Franch T, Pedersen K, Mikkelsen ND (1997). "Antisense RNA-reglerad programmerad celldöd". Annu. Rev. Genet . 31 : 1–31. doi : 10.1146/annurev.genet.31.1.1 . PMID 9442888 .
- Poulsen LK, Larsen NW, Molin S, Andersson P (november 1989). "En familj av gener som kodar för en celldödande funktion kan bevaras i alla gramnegativa bakterier". Mol. Microbiol . 3 (11): 1463–1472. doi : 10.1111/j.1365-2958.1989.tb00131.x . PMID 2693900 . S2CID 41192501 .
- Hayes F (september 2003). "Toxiner-antitoxiner: plasmidunderhåll, programmerad celldöd och cellcykelstopp". Vetenskap . 301 (5639): 1496–1499. Bibcode : 2003Sci...301.1496H . doi : 10.1126/science.1088157 . PMID 12970556 . S2CID 10028255 .
- Gerdes K, Rasmussen PB, Molin S (maj 1986). "Unik typ av plasmidunderhållsfunktion: postsegregationell dödande av plasmidfria celler" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (10): 3116–3120. Bibcode : 1986PNAS...83.3116G . doi : 10.1073/pnas.83.10.3116 . PMC 323463 . PMID 3517851 .