PTS L-askorbatfamilj
| Fosfotransferaspermeasidentifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| _ | |||||||||
| Symbol | PTS | ||||||||
| Pfam | PF03611 | ||||||||
| InterPro | IPR004703 | ||||||||
| TCDB | 4.A.7 | ||||||||
| OPM superfamilj | 426 | ||||||||
| OPM-protein | 5zov | ||||||||
| |||||||||
PTS L-askorbatfamiljen (L-Asc) ( TC# 4.A.7 ) inkluderar bärare som är specifika för L-askorbat och är en del av PTS-AG-superfamiljen . En enda PTS-permeas av L-Asc-familjen av PTS-permeaser har karaktäriserats funktionellt. Detta är SgaTBA-systemet, omdöpt till UlaABC ( användning av L - en scorbate) av Yew och Gerlt.
SgaTBA-systemet
SgaTBA-permeaset består av tre proteiner: SgaT, SgaB och SgaA. SgaT är ett 12 TMS-protein, möjligen mycket avlägset besläktat med MFS-hexuronatpermeaset från Escherichia coli ( TC# 2.A.1.14.2), som förmodligen fungerar som ett PTS IIC-protein. Denna genprodukt, liksom SgaB och SgaA, är alla viktiga för anaerob L-askorbatanvändning, transport och fosforylering . Detta är det första dokumenterade exemplet där de två sockerspecifika energikopplande proteinerna i en PTS-permeas är närmare besläktade med proteinerna i två olika familjer. Sga - regleringen kontrolleras av den närliggande YjfQ-repressorn.
Homologi
Homologer av SgaT, liksom andra PTS-proteinhomologer, har identifierats i ett stort antal evolutionärt divergerande bakterier , men inte i archaea eller eukaryoter . Bakterier som kodar SgaT-homologer inkluderar många gramnegativa Pseudomonadota , såväl som många grampositiva bakterier med låg och hög G+C . Förutom arter av Corynebacterium , Streptomyces och Bacillus . är nästan alla organismer som har SgaTBA-homologer mänskliga/djur - patogener
Flera organismer har två eller flera SgaT-paraloger, inklusive E. coli, som har tre. I några av de homologer som finns i andra bakterier är SgaB-domäner fusionerade C-terminala till SgaT-domänerna. Till exempel gäller detta för förmodade transportörer i Vibrio cholerae , Pasteurella multocida och Mycoplasma pulmonis . Homologer av SgaB och SgaA, men inte SgaT, finns också i transkriptionella aktivatorproteiner där de fungerar i reglering snarare än sockertransport.
Transportreaktion
Grupptranslokationsreaktionen katalyserad av SgaTBA är:
- L-askorbat (ut) → L-askorbat-6-fosfat (in)
Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "4.A.7 The PTS L-Ascorbate (L-Asc) Family" , som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , men inte under GFDL . Alla relevanta villkor måste följas.