PQBP1

PQBP1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, MRX2, MRX55, MRXS3, MRXS8, NPW38, RENS1, SHS, polyglutaminbindande protein 1
Externa ID :n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ; ; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Polyglutaminbindande protein 1 (PQBP1) är ett protein som hos människor kodas av PQBP1 -genen .

Polyglutaminbindande protein-1, som identifierades som ett bindande protein till polyglutaminkanalsekvensen, är ett evolutionärt konserverat protein som uttrycks i olika vävnader inklusive utvecklings- och vuxna hjärnor eller mesodermala vävnader. I celler är PQBP1 dominerande lokaliserat i kärnan men även i cytoplasman beroende på celltyp och stressförhållanden.

Det bör noteras att PQBP1 inte har något samband med QBP1, en konstgjord syntetisk peptid.

Fungera

PQBP1 är ett nukleärt polyglutaminbindande protein som innehåller en WW-domän .

De molekylära rollerna för PQBP1 är huvudsakligen i mRNA-splitsning och transkription. PQBP1 interagerar med splitsningsproteiner och RNA-bindande proteiner. PQBP1-brist påverkar kritiskt mRNA-splitsning av cellcykeln och synapsrelaterade gener. Dessutom indikerade nya resultat implikation av PQBP1 i cytoplasmatisk RNA-metabolism och förlängning av proteintranslation från mRNA.

Klinisk signifikans

Mutationer i PQBP1-genen, som kodar för detta protein, har varit kända för att orsaka X-länkade intellektuella funktionsnedsättningar (XLID), vanligtvis kallad Renpennings syndrom . Människor som lider av dessa funktionshinder delar en vanlig uppsättning symtom inklusive: mikrocefali, förkortad kroppsbyggnad och nedsatt intellektuell utveckling. Det finns 11 typer av mutationer som har identifierats, men den vanligaste är frameshift-mutationer. Andra syndromiska XLIDs såsom Golabi-Ito-Hall syndrom och icke-syndromiska ID-patienter var också associerade med PQBP1- genmutationer.

Mutant Ataxin-1 och Huntingtin , sjukdomsproteiner av spinocerebellär ataxi typ-1 respektive Huntingtons sjukdom , interagerar med PQBP1 och störde funktionerna hos PQBP1. Dessutom avslöjade nya undersökningar patologiska roller för PQBP1 i neuroner och mikroglia under neurodegeneration av Alzheimers sjukdom och tauopati. SRRM2-fosforylering som detekteras i neuroner i ett tidigt skede av Alzheimers sjukdomspatologi leder till minskning av SRRM2, ett ställningsprotein för RNA-metabolismrelaterade molekyler i kärnan, vilket orsakar minskning av PQBP1 i kärnan och förvärvad intellektuell funktionsnedsättning. PQBP1 visades som en intracellulär receptor för HIV1 i dendritiska celler för det medfödda immunsystemet . På liknande sätt fungerar PQBP1 som en intracellulär receptor för tau-proteiner och utlöser hjärninflammation.

Djurmodeller

Musmodeller av knockdown och villkorlig knockout genererades, och de visade kognitiv funktionsnedsättning och mikrocefali. KD-mössen har en transgen som uttrycker 498 bp dubbelsträngat RNA som är endogent klyvd till siRNA som effektivt undertrycker PQBP1 och visade inte uppenbar utvecklingsavvikelse. En annan knockdown-modell av genen i primära neuroner hos musembryon visade en minskning av splitsningseffektiviteten och resulterade i onormal gastrulation och neuralationsmönster.

Drosophila-modeller för underuttryck och överuttryck genererades också. Den hypomorfa Drosophila-modellen avslöjade molekylär funktion hos PQBP1 vid inlärningsförvärv medierad av minskade mRNA- och proteinuttryck av NMDA-receptorsubenhet NR1. Forskning tyder på att proteinet måste uttryckas inom ett kritiskt område för att fungera korrekt.

Vidare läsning

Fox P, Fox D, Gerrard JW (1981). "X-länkad mental retardation: Renpenning återbesökt". American Journal of Medical Genetics . 7 (4): 491–495. doi : 10.1002/ajmg.1320070409 . PMID 7211958 .
Stevenson RE, Arena JF, Ouzts E, Gibson A, Shokeir MH, Vnencak-Jones C, et al. (maj 1998). "Renpennings syndrom mappar till Xp11" . American Journal of Human Genetics . 62 (5): 1092–1101. doi : 10.1086/301835 . PMC 1377092 . PMID 9545405 .
Deqaqi SC, N'Guessan M, Forner J, Sbiti A, Beldjord C, Chelly J, et al. (1998). "En gen för icke-specifik X-länkad mental retardation (MRX55) finns i Xp11". Annales de Génétique . 41 (1): 11–16. PMID 9599645 .
Komuro A, Saeki M, Kato S (maj 1999). "Npw38, ett nytt nukleärt protein som har en WW-domän som kan aktivera basal transkription" . Nukleinsyraforskning . 27 (9): 1957–1965. doi : 10.1093/nar/27.9.1957 . PMC 148407 . PMID 10198427 .
Komuro A, Saeki M, Kato S (december 1999). "Association av två nukleära proteiner, Npw38 och NpwBP, via interaktionen mellan WW-domänen och ett nytt prolinrikt motiv som innehåller glycin och arginin. " Journal of Biological Chemistry . 274 (51): 36513–36519. doi : 10.1074/jbc.274.51.36513 . PMID 10593949 .
Waragai M, Junn E, Kajikawa M, Takeuchi S, Kanazawa I, Shibata M, et al. (juli 2000). "PQBP-1/Npw38, ett nukleärt protein som binder till polyglutaminkanalen, interagerar med U5-15kD/dim1p via den karboxylterminala domänen". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 273 (2): 592–595. doi : 10.1006/bbrc.2000.2992 . PMID 10873650 .
Zhang Y, Lindblom T, Chang A, Sudol M, Sluder AE, Golemis EA (oktober 2000). "Bevis på att dim1 associerar med proteiner som är involverade i pre-mRNA-splitsning och avgränsning av rester som är väsentliga för dim1-interaktioner med hnRNP F och Npw38/PQBP-1". Gene . 257 (1): 33–43. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00372-3 . PMID 11054566 .
Iwamoto K, Huang Y, Ueda S (december 2000). "Genomisk organisation och alternativa transkript av den mänskliga PQBP-1-genen". Gene . 259 (1–2): 69–73. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00437-6 . PMID 11163963 .
Okazawa H, Rich T, Chang A, Lin X, Waragai M, Kajikawa M, et al. (maj 2002). "Interaktion mellan mutant ataxin-1 och PQBP-1 påverkar transkription och celldöd" . Neuron . 34 (5): 701–713. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00697-9 . PMID 12062018 .
Kalscheuer VM, Freude K, Musante L, Jensen LR, Yntema HG, Gécz J, et al. (december 2003). "Mutationer i genen för polyglutaminbindande protein 1 orsakar X-länkad mental retardation". Naturgenetik . 35 (4): 313–315. doi : 10.1038/ng1264 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8953-D . PMID 14634649 . S2CID 27007340 .
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, et al. (juni 2004). "Transkriptomkarakterisering belyser signalnätverk som styr mänsklig ES-celltillväxt och differentiering". Natur Bioteknik . 22 (6): 707–716. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Kleefstra T, Franken CE, Arens YH, Ramakers GJ, Yntema HG, Sistermans EA, et al. (oktober 2004). "Genotyp-fenotypstudier i tre familjer med mutationer i den polyglutaminbindande protein 1-genen (PQBP1)". Klinisk genetik . 66 (4): 318–326. doi : 10.1111/j.1399-0004.2004.00308.x . PMID 15355434 . S2CID 34100315 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (januari 2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Stevenson RE, Bennett CW, Abidi F, Kleefstra T, Porteous M, Simensen RJ, et al. (maj 2005). "Renpennings syndrom kommer i fokus". American Journal of Medical Genetics. Del A . 134 (4): 415–421. doi : 10.1002/ajmg.a.30664 . PMID 15782410 . S2CID 24333408 .
Marubuchi S, Wada Y, Okuda T, Hara Y, Qi ML, Hoshino M, et al. (november 2005). "Polyglutamin-kanalbindande protein-1-dysfunktion inducerar celldöd hos neuroner genom mitokondriell stress". Journal of Neurochemistry . 95 (3): 858–870. doi : 10.1111/j.1471-4159.2005.03405.x . PMID 16104847 . S2CID 30033589 .

externa länkar

PQBP1 human genplacering i UCSC Genome Browser .
PQBP1 human gendetaljer i UCSC Genome Browser .
Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : O60828 (Polyglutaminbindande protein 1) vid PDBe-KB .