PCBP1

PCBP1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HEL-S-85, HNRPE1, HNRPX, hnRNP-E1, hnRNP-X, poly(rC)-bindande protein 1
Externa ID :n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Poly(rC)-bindande protein 1 är ett protein som hos människor kodas av PCBP1 -genen .

Denna intronlösa gen tros ha genererats genom retrotransposition av ett fullständigt bearbetat PCBP-2-mRNA. Denna gen och PCBP-2 har paraloger (PCBP3 och PCBP4) som tros ha uppstått som ett resultat av dupliceringshändelser av hela gener. Proteinet som kodas av denna gen verkar vara multifunktionellt. Det motsvarar tillsammans med PCBP2 och HNRNPK det huvudsakliga cellulära poly(rC)-bindande proteinet. Den innehåller tre K-homologa (KH) domäner som kan vara involverade i RNA-bindning. Detta kodade protein tillsammans med PCBP-2 fungerar också som translationella koaktivatorer av poliovirus -RNA via en sekvensspecifik interaktion med stam-loop IV av IRES och främjar poliovirus-RNA-replikation genom att binda till dess 5'-terminala klöverbladsstruktur.

Det har också varit inblandat i translationell kontroll av 15-lipoxygenas-mRNA, humant papillomvirus typ 16 L2-mRNA och hepatit A- virus-RNA. Det kodade proteinet föreslås också spela en roll i bildandet av ett sekvensspecifikt alfa-globin-mRNP-komplex som är associerat med alfa-globin-mRNA-stabilitet.

Vidare läsning

•    Kiledjian M, Wang X, Liebhaber SA (1995). "Identifiering av två KH-domänproteiner i alfa-globin-mRNP-stabilitetskomplexet" . EMBO J . 14 (17): 4357–64. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00110.x . PMC 394520 . PMID 7556077 .
•   Leffers H, Dejgaard K, Celis JE (1995). "Karakterisering av två stora cellulära poly(rC)-bindande humana proteiner, som var och en innehåller tre K-homologa (KH) domäner". Eur. J. Biochem . 230 (2): 447–53. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20581.x . PMID 7607214 .
•    Aasheim HC, Loukianova T, Deggerdal A, Smeland EB (1994). "Vävnadsspecifikt uttryck och cDNA-struktur av ett humant transkript som kodar för ett nukleinsyrabindande [oligo(dC)]-protein relaterat till det pre-mRNA-bindande proteinet K." Nucleic Acids Res . 22 (6): 959–64. doi : 10.1093/nar/22.6.959 . PMC 307915 . PMID 8152927 .
•    Blyn LB, Swiderek KM, Richards O, et al. (1996). "Poly(rC)-bindande protein 2 binder till stam-loop IV av poliovirus RNA 5' icke-kodande region: identifiering genom automatiserad vätskekromatografi-tandem masspektrometri" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (20): 11115–20. Bibcode : 1996PNAS...9311115B . doi : 10.1073/pnas.93.20.11115 . PMC 38293 . PMID 8855318 .
•    Kiledjian M, DeMaria CT, Brewer G, Novick K (1997). "Identifiering av AUF1 (heterogent nukleärt ribonukleoprotein D) som en komponent i alfa-globin-mRNA-stabilitetskomplexet" . Mol. Cell. Biol . 17 (8): 4870–6. doi : 10.1128/MCB.17.8.4870 . PMC 232339 . PMID 9234743 .
•    Wang Z, Day N, Trifillis P, Kiledjian M (1999). "Ett mRNA-stabilitetskomplex fungerar med poly(A)-bindande protein för att stabilisera mRNA in vitro" . Mol. Cell. Biol . 19 (7): 4552–60. doi : 10.1128/MCB.19.7.4552 . PMC 84253 . PMID 10373504 .
•   Makeyev AV, Chkheidze AN, Liebhaber SA (1999). "En uppsättning mycket konserverade RNA-bindande proteiner, alfaCP-1 och alfaCP-2, inblandade i mRNA-stabilisering, samuttrycks från en intronlös gen och dess introninnehållande paralog" . J. Biol. Chem . 274 (35): 24849–57. doi : 10.1074/jbc.274.35.24849 . PMID 10455157 .
•   Makeyev AV, Liebhaber SA (2000). "Identifiering av två nya däggdjursgener etablerar en underfamilj av KH-domän RNA-bindande proteiner". Genomik . 67 (3): 301–16. doi : 10.1006/geno.2000.6244 . PMID 10936052 .
•    Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, et al. (2001). "Protein-proteininteraktionspanel som använder mus fullängds-cDNA" . Genome Res . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
•    Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). "Riktad proteomisk analys av den mänskliga nukleolen" . Curr. Biol . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
•   Yeap BB, Voon DC, Vivian JP, et al. (2002). "Ny bindning av HuR och poly(C)-bindande protein till ett konserverat UC-rikt motiv inom den 3'-otranslaterade regionen av androgenreceptorns budbärar-RNA. " J. Biol. Chem . 277 (30): 27183–92. doi : 10.1074/jbc.M202883200 . PMID 12011088 .
•    Walter BL, Persley TB, Ehrenfeld E, Semler BL (2002). "Distinkt poly(rC) bindande protein KH-domän determinanter för poliovirus translationsinitiering och viral RNA-replikation" . J. Virol . 76 (23): 12008–22. doi : 10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002 . PMC 136902 . PMID 12414943 .
•   Giles KM, Daly JM, Beveridge DJ, et al. (2003). "Den 3'-otranslaterade regionen av p21WAF1 mRNA är en sammansatt cis-verkande sekvens bunden av RNA-bindande proteiner från bröstcancerceller, inklusive HuR och poly(C)-bindande protein" . J. Biol. Chem . 278 (5): 2937–46. doi : 10.1074/jbc.M208439200 . PMID 12431987 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Pickering BM, Mitchell SA, Evans JR, Willis AE (2003). "Polypyrimidin-kanalbindande protein och poly r(C)-bindande protein 1 interagerar med BAG-1 IRES och stimulerar dess aktivitet in vitro och in vivo" . Nucleic Acids Res . 31 (2): 639–46. doi : 10.1093/nar/gkg146 . PMC 140511 . PMID 12527772 .
•    Pillai MR, Chacko P, Kesari LA, et al. (2003). "Uttryck av folatreceptorer och heterogent nukleärt ribonukleoprotein E1 hos kvinnor med humant papillomvirusmedierad omvandling av livmoderhalsvävnad till cancer. " J. Clin. Patol . 56 (8): 569–74. doi : 10.1136/jcp.56.8.569 . PMC 1770025 . PMID 12890803 .
•   Adams DJ, Beveridge DJ, van der Weyden L, et al. (2004). "HADHB, HuR och CP1 binder till den distala 3'-otranslaterade regionen av humant renin-mRNA och differentiellt modulerar reninexpression" . J. Biol. Chem . 278 (45): 44894–903. doi : 10.1074/jbc.M307782200 . PMID 12933794 .
•   Evans JR, Mitchell SA, Spriggs KA, et al. (2003). "Medlemmar i familjen poly (rC) bindande protein stimulerar aktiviteten av c-myc interna ribosominträdessegment in vitro och in vivo" . Onkogen . 22 (39): 8012–20. doi : 10.1038/sj.onc.1206645 . PMID 12970749 .
•    Chkheidze AN, Liebhaber SA (2003). "En ny uppsättning nukleära lokaliseringssignaler bestämmer fördelningarna av de alfaCP RNA-bindande proteinerna" . Mol. Cell. Biol . 23 (23): 8405–15. doi : 10.1128/MCB.23.23.8405-8415.2003 . PMC 262676 . PMID 14612387 .