Orkidéfläck dichorhavirus

Orkidéfläck dichorhavirus
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Negarnaviricota
Klass:	Monjiviricetes
Beställa:	Mononegavirales
Familj:	Rhabdoviridae
Släkte:	Dichorhavirus
Arter:	Orkidéfläck dichorhavirus
Synonymer
Orchid fleck virus

Orchid fleck dichorhavirus , vanligen kallat Orchid fleck virus (OFV), är ett icke-hölje, segmenterat, enkelsträngat (ss) RNA negativt-strängat virus , överfört av den falska spindelkvalster , Brevipalpus californicus . OFV orsakar nekrotiska och klorotiska lesioner på bladen hos många släkten i familjen Orchidaceae .

Introduktion

Orkidé-fläckvirus, trots sin närvaro över hela världen, påverkar bara ett litet spektrum av mänskligt liv. Orkidéer används inte till mat utan tjänar snarare främst som prydnadsdekoration. Därför skrivs endast cirka 2 till 3 vetenskapliga rapporter om OFV varje år. Hela genomet av OFV har sekvenserats och dess sex huvudproteinprodukter har också sekvenserats.

Mycket är fortfarande inte känt om OFV, inklusive hur exakt och varför vektorkvalster reser från orkidé till orkidé, och fler värdarter av blommor upptäcks årligen. Ju mer information forskare upptäcker, desto mer inser de att det fortfarande finns mycket kvar att lära sig. Många orkidéentusiaster deltar i " medborgarvetenskap " genom att publicera sina OFV-relaterade resultat på internationella trädgårdsbloggar och forum.

Virion morfologi

OFV beskrevs först som bacilliform men beroende på beredningsmetod kan OFV se kulformad eller bacilliform. I genomsnitt är OFV 40 nm i diameter och mellan 100 och 150 nm lång. Varje viral partikel är organiserad i en tät 25 varv helix, med en stigning på cirka 4,5 nm.

Genomik

respektive 6001 baspar . GenBank innehåller hela det sekvenserade genomet av OFV. RNA1 (GenBank AB244417) kodar för fem proteiner medan RNA2 (GenBank AB244418) bara kodar för ett. Båda strängarna har öppna läsramar (ORF), som läses i negativ mening.

RNA1

• ORF1: Nukleokapsid (N) protein
• ORF2: Fosfoprotein (P)
• ORF3: Proteiner involverade i viral cell-till-cell-rörelse
• ORF4: Matris (M) protein
• ORF5: Glykoprotein (G)

RNA2

• ORF6: Polymeras (L) protein ( RNA-beroende RNA-polymeras )

Patofysiologi

Klorotiska och nekrotiska fläckar, fläckar och/eller ringfläckar, såväl som gula fläckar eller fläckar är alla symtom på en OFV- infektion . Studier har också visat att OFV kan förhindra spridning av andra virus i en redan OFV-infekterad växt.

Vektor

Den falska spindelkvalstret, B. californicus, fungerar som huvudvektor för OFV. Brevipalpus- kvalster går igenom fyra distinkta, aktiva livsstadier, var och en åtskilda av icke-rörliga chrysalisstadier . Protonymf-, deutonymf- och vuxenstadierna kan infektera sina värdväxter med OFV, medan larvstadiet inte är smittsamt. Även efter tre veckors inkubation av en OFV-positiv kvalster på en OFV-resistent växt visade sig B. californicus fortfarande vara smittsam, vilket visar att OFV är persistent.

Värdar

OFV kan naturligt infektera omkring 50 olika arter i 31 släkten, alla tillhörande familjen Orchidaceae. 25 andra arter från 11 icke-orkidéfamiljer har infekterats genom savöverföring eller artificiell viral ympning.

Livscykel

Studier har inte visat huruvida OFV faktiskt replikerar inom B. californicus eller inte, men elektronmikroskopi har avslöjat en intrikat viral livscykel i värdcellerna.

Viralt ssRNA replikeras och transkriberas till mRNA i värdcellens kärna . Viralt mRNA exporteras sedan ut från kärnan till cytoplasman där det översätts till viralt protein av värdens ribosomer . De virala proteinerna kommer sedan in i kärnan igen där de aggregeras till en viroplasma . Där samlas de olika virala strukturella proteinerna med båda strängarna av ssRNA för att bilda kompletta OFV-partiklar. Dessa partiklar samlas ofta mellan de inre och yttre kärnmembranen och orsakar synliga projektioner som ofta evaginerar in i cytoplasmatiska vesiklar . Elektronmikroskopi har avslöjat kluster av virala partiklar placerade vinkelrätt mot det inre kärnmembranet, det endoplasmatiska retikulumet , såväl som de tidigare nämnda cytoplasmatiska vesiklerna, som bildar distinkta "ekrade hjul"-strukturer.

Effekter på konditionen

Infekterade orkidéer blommar inte lika bra som friska, vilket påverkar effektiviteten av pollinering och befruktning . Dessutom ser orkidéerna som blommar livlösa ut, vilket gör dem mindre attraktiva på snittblomsmarknaden.

Epidemiologi

Fall av orkidéfläckvirus eller OF-liknande virus har rapporterats i Australien, Brasilien, Kina, Columbia, Costa Rica, Danmark, Tyskland, Japan, Korea, Sydafrika och USA, dvs alla kontinenter utom Antarktis.

På grund av det faktum att virus är beroende av sin värdcell för replikering, kan OFV inte odlas oberoende. Två icke-orkidéindikatorvärdar (växter som används i forskning som visar karakteristiska symtom på specifika virusinfektioner) C. quinoa och T. expansa används vanligtvis för viral ympning och isolering.

Det finns inga kända patogener för själva OFV men dess vektor, B. californicus, har ett symbiotiskt förhållande med bakterier av släktet Cardinium . Symbionten är orsaken till kvalstrens thelytokous reproduktionsmetod (där honor produceras från obefruktade ägg) och förklaringen till frånvaron av B. californicus- hankvalster.

Diagnos

Tunna vävnadsprover från växter med synliga symtom på OFV kan genomgå:

• Elektronmikroskopi för att visualisera virioner och kompletta virala partiklar
• Serologisk analys för att identifiera och isolera specifika virala proteiner
• Omvänd transkription-polymeraskedjereaktion för att identifiera viralt RNA

Förebyggande

Metoder för att förhindra spridning av OFV mellan separata växter:

• Se till att plantorna är virusfria
• Förbättra karantänsåtgärder _
• Eliminera infektionskällor (kvalster eller andra infekterade växter)
• Säkerställ rätt miljö för odling
• Arbeta för att utveckla OFV-resistenta växter genom genteknik

Behandling

När en växt väl är infekterad med OFV är det oklart om beskärning av synligt infekterad vävnad kommer att bota växten från viruset. Det är också oklart om infekterade växter producerar frön som innehåller viruspartiklar.

Historia

Det tidigaste registrerade arbetet om Orchid Fleck Virus publicerades i Japan 1969. OFV rapporterades som koncentrationer av korta, stavliknande partiklar i klorotiska lesioner på bladen av båtorkidéer av släktet Cymbidium .

Mänsklig relevans

Orkidéer och andra tropiska blommor är extremt viktiga för jordbruksekonomin i många sydostasiatiska länder. Vanda ' Miss Joaquim' orkidéhybrid är Singapores nationalblomma. Enligt Orchid Society är världsmarknaden för orkidéer värd mer än 1 miljard dollar med Japan och USA i spetsen 2010. I USA producerades 2005 orkidéer för cirka 144 miljoner dollar.