NAIP (gen)

NAIP
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BIRC1, NLRB1, psiNLR-familjen, apoptoshämmande protein, NLR-familjen apoptoshämmande protein
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Baculoviral IAP repeat-innehållande protein 1 är ett protein som hos människor kodas av NAIP -genen .

Denna gen är en del av en 500 kb inverterad duplicering på kromosom 5q 13. Denna duplicerade region innehåller minst fyra gener och repetitiva element som gör den benägen för omarrangemang och deletioner. Repetitiviteten och komplexiteten hos sekvensen har också orsakat svårigheter att bestämma organisationen av denna genomiska region. Denna kopia av genen är fullängd; ytterligare kopior med trunkationer och interna deletioner finns också i denna region av kromosom 5q13. Man tror att denna gen är en modifierare av spinal muskelatrofi orsakad av mutationer i en närliggande gen, SMN1 . Proteinet som kodas av denna gen innehåller regioner med homologi med två baculovirushämmare av apoptosproteiner , och det kan undertrycka apoptos inducerad av olika signaler. Alternativt splitsade transkriptvarianter som kodar för distinkta isoformer har hittats för denna gen.

Vidare läsning

•    van der Steege G, Draaijers TG, Grootscholten PM, et al. (1995). "En provisorisk transkriptionskarta över den kritiska regionen av spinal muskelatrofi (SMA). Eur. J. Hum. Genet . 3 (2): 87–95. doi : 10.1159/000472281 . PMID 7552146 . S2CID 46083524 .
•    Liston P, Roy N, Tamai K, et al. (1996). "Undertryckning av apoptos i däggdjursceller av NAIP och en besläktad familj av IAP-gener". Naturen . 379 (6563): 349–53. Bibcode : 1996 Natur.379..349L . doi : 10.1038/379349a0 . PMID 8552191 . S2CID 4305853 .
•   Chen Q, Baird SD, Mahadevan M, et al. (1998). "Sekvens av en 131-kb region av 5q13.1 innehållande de spinala muskelatrofi-kandidatgenerna SMN och NAIP". Genomik . 48 (1): 121–7. doi : 10.1006/geno.1997.5141 . PMID 9503025 .
•   Monani UR, Lorson CL, Parsons DW, et al. (1999). "En enda nukleotidskillnad som förändrar splitsningsmönster skiljer SMA-genen SMN1 från kopigenen SMN2" . Brum. Mol. Genet . 8 (7): 1177–83. doi : 10.1093/hmg/8.7.1177 . PMID 10369862 .
•   Yamamoto K, Sakai H, Hadano S, et al. (1999). "Identifiering av två distinkta transkript för den neuronala apoptoshämmande proteingenen". Biochem. Biophys. Res. Commun . 264 (3): 998–1006. doi : 10.1006/bbrc.1999.1615 . PMID 10544044 .
•    Mercer EA, Korhonen L, Skoglösa Y, et al. (2000). "NAIP interagerar med hippocalcin och skyddar neuroner mot kalciuminducerad celldöd genom kaspas-3-beroende och -oberoende vägar" . EMBO J . 19 (14): 3597–607. doi : 10.1093/emboj/19.14.3597 . PMC 313967 . PMID 10899114 .
•    Sanna MG, da Silva Correia J, Ducrey O, et al. (2002). "IAP-dämpning av apoptos involverar distinkta mekanismer: TAK1/JNK1-signalkaskaden och kaspasinhibering" . Mol. Cell. Biol . 22 (6): 1754–66. doi : 10.1128/MCB.22.6.1754-1766.2002 . PMC 135597 . PMID 11865055 .
•   Akutsu T, Nishio H, Sumino K, et al. (2002). "Molekylär genetik för spinal muskelatrofi: bidrag från NAIP-genen till klinisk svårighetsgrad". Kobe Journal of Medical Sciences . 48 (1–2): 25–31. PMID 11912351 .
•   Xu M, Okada T, Sakai H, et al. (2002). "Funktionella mänskliga NAIP-promotortranskriptionsreglerande element för NAIP- och PsiNAIP-generna". Biochim. Biophys. Acta . 1574 (1): 35–50. doi : 10.1016/S0167-4781(01)00343-8 . PMID 11955612 .
•   Notarbartolo M, Cervello M, Dusonchet L, D'Alessandro N (2002). "NAIP-deltaEx10-11: en ny splitsningsvariant av apoptoshämmaren NAIP uttryckt på olika sätt i läkemedelskänsliga och multiresistenta HL60-leukemiceller". Leuk. Res . 26 (9): 857–62. doi : 10.1016/S0145-2126(02)00016-4 . PMID 12127562 .
•   Lindholm D, Mercer EA, Yu LY, et al. (2002). "Neuronalt apoptoshämmande protein: Strukturella krav för hippocalcinbindning och effekter på överlevnad av NGF-beroende sympatiska neuroner". Biochim. Biophys. Acta . 1600 (1–2): 138–47. doi : 10.1016/S1570-9639(02)00454-5 . PMID 12445469 .
•    Damiano JS, Oliveira V, Welsh K, Reed JC (2004). "Heterotypiska interaktioner mellan NACHT-domäner: implikationer för reglering av medfödda immunsvar" . Biochem. J . 381 (Pt 1): 213–9. doi : 10.1042/BJ20031506 . PMC 1133779 . PMID 15107016 .
•   Davoodi J, Lin L, Kelly J, et al. (2004). "Neuronalt apoptoshämmande protein interagerar inte med Smac och kräver ATP för att binda kaspas-9" . J. Biol. Chem . 279 (39): 40622–8. doi : 10.1074/jbc.M405963200 . PMID 15280366 .
•   Aubin D, Gagnon A, Grunder L, et al. (2004). "Adipogena och antiapoptotiska proteinnivåer i mänskliga fettstromaceller efter viktminskning" . Obes. Res . 12 (8): 1231–4. doi : 10.1038/oby.2004.156 . PMID 15340105 .
•   Schmutz J, Martin J, Terry A, et al. (2004). "DNA-sekvensen och jämförande analys av human kromosom 5" . Naturen . 431 (7006): 268–74. Bibcode : 2004Natur.431..268S . doi : 10.1038/nature02919 . PMID 15372022 .
•    Romanish MT, Lock WM, van de Lagemaat LN, et al. (2007). "Upprepad rekrytering av LTR-retrotransposoner som promotorer av det anti-apoptotiska locus NAIP under däggdjursutveckling" . PLOS Genet . 3 (1): e10. doi : 10.1371/journal.pgen.0030010 . PMC 1781489 . PMID 17222062 .
•   Maier JK, Balabanian S, Coffill CR, et al. (2007). "Fördelning av neuronalt apoptoshämmande protein i mänskliga vävnader" . J. Histochem. Cytochem . 55 (9): 911–23. doi : 10.1369/jhc.6A7144.2007 . PMID 17510375 .

externa länkar

• Neuronal+apoptoshämmande+protein vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q13075 (Baculoviral IAP repeat-innehållande protein 1) vid PDBe-KB .