Mykobakteriell porin
MspA- | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||
Symbol | MspA | ||||||||
Pfam | PF09203 | ||||||||
InterPro | IPR015286 | ||||||||
SCOP2 | 1uun / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 1.B.24 | ||||||||
OPM superfamilj | 268 | ||||||||
OPM-protein | 1uun | ||||||||
|
Mykobakteriella poriner är en grupp transmembrana beta-fatproteiner som produceras av mykobakterier , som tillåter hydrofila näringsämnen att komma in i bakterien. De är belägna i det ogenomträngliga mykobakteriella yttre membranet, eller mykomembranet hos snabbväxande mykobakterier. Mykomembranet är unikt och består av mycket långkedjiga fettsyror, mykolsyror. Dessa proteiner skiljer sig strukturellt från de typiska poriner som finns i det yttre membranet av gramnegativa bakterier . Till exempel bildar MspA-proteinet en tätt sammankopplad oktamer med åttafaldig rotationssymmetri som liknar en bägare och innehåller en central kanal. Varje proteinsubenhet innehåller en beta-smörgås av immunglobulinliknande topologi och en beta-bandarm som bildar en oligomer transmembran beta-fat .
MspA har biotekniska tillämpningar, framför allt inom nanopore-sekvensering .