Proteintopologi
Proteintopologi är en egenskap hos en proteinmolekyl som inte förändras under deformation (utan att skära eller bryta en bindning).
Ramar
Två huvudtopologiramar har utvecklats och applicerats på proteinmolekyler.
Knutteori
Knutteori som kategoriserar kedjeförvecklingar. Användningen av knutteori är begränsad till en liten andel proteiner eftersom de flesta av dem är oknutna.
Kretstopologi
Kretstopologin kategoriserar kontakter inom kedjan baserat på deras arrangemang.
Andra användningsområden
I biologilitteraturen används termen topologi också för att hänvisa till ömsesidig orientering av vanliga sekundära strukturer , såsom alfa-helixer och betasträngar i proteinstruktur [1] . Till exempel kan två intilliggande interagerande alfa-helixar eller beta-strängar gå i samma eller i motsatta riktningar. Topologidiagram av olika proteiner med känd tredimensionell struktur tillhandahålls av PDBsum ( ett exempel) .
Se även
externa länkar