MED15

MED15
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ARC105, CAG7A, CTG7A, PCQAP, TIG-1, TIG1, TNRC7, medlarkomplex underenhet 15
externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Mediator av RNA-polymeras II-transkriptionssubenhet 15 , även känd som Gal11 , Spt13 i jäst och PCQAP , ARC105 eller TIG-1 hos människor är ett protein som kodas av MED15 - genen .

Fungera

MED15 är en allmän transkriptionskofaktor för mediatorkomplexet som är involverat i RNA-polymeras II-beroende transkription, ursprungligen kallad Gal11 och Spt13 och finns i jäst som en väsentlig faktor för Gal4- beroende transaktivering av T.Fukasawa och F.Winston labs. Transkriptionsfaktorer Gcn4, Pho4, Msn2, Ino2, medlemmar av Gal4 -familjen - Gal4 , Oaf1, Pdr1 och viral VP16 har rapporterats interagera med jäst MED15.

De flesta av dessa transkriptionsfaktorer delar samma transaktiveringsdomän, 9aaTAD, som direkt interagerar med KIX-domänen i MED15.

Dessutom samarbetar humant MED15 i mediatorkomplex (tidigare känt som PC2, ARC eller DRIP) med transkriptionsfaktorer som VP16 och SREBP . Humant SREBP reglerar sterolkänsligt genuttryck, och denna reglerande verkan bevaras i den genetiska modellorganismen C. elegans , en rundmask (homologer MDT-15 och SBP-1). Även i C. elegans är MDT-15 väsentligt för svaret på flera påfrestningar (fasta, tungmetaller, toxiner och oxidativ stress); åtminstone delvis förlänas fastesvaret av interaktioner mellan MDT-15 och nukleära receptorer , inklusive NHR-49.

Gen

MED15-genen innehåller sträckor av trinukleotidupprepningar och är belägen i kromosom 22-regionen som är raderad i DiGeorges syndrom . Två transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har hittats för denna gen.

Vidare läsning

Taubert S, Hansen M, Van Gilst MR, Cooper SB, Yamamoto KR (feb 2008). Mango SE (red.). "Medlarsubenheten MDT-15 ger metabol anpassning till intaget material" . PLOS Genetik . 4 (2): e1000021. doi : 10.1371/journal.pgen.1000021 . PMC 2265483 . PMID 18454197 .
Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (juli 1997). "cDNA med långa CAG-trinukleotidupprepningar från mänsklig hjärna". Human Genetik . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .
Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (apr 1999). "Komposit co-activator ARC förmedlar kromatinriktad transkriptionell aktivering". Naturen . 398 (6730): 828–32. Bibcode : 1999Natur.398..828N . doi : 10.1038/19789 . PMID 10235267 . S2CID 23646963 .
Taubert S, Van Gilst MR, Hansen M, Yamamoto KR (maj 2006). "En Mediator-subenhet, MDT-15, integrerar reglering av fettsyrametabolism genom NHR-49-beroende och -oberoende vägar i C. elegans" . Gener & Utveckling . 20 (9): 1137–49. doi : 10.1101/gad.1395406 . PMC 1472473 . PMID 16651656 .
Abraham S, Solomon WB (sep 2000). "Ett nytt glutaminrikt förmodat transkriptionsadapterprotein (TIG-1), företrädesvis uttryckt i placenta och benmärgsvävnader". Gene . 255 (2): 389–400. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00292-4 . PMID 11024300 .
Berti L, Mittler G, Przemeck GK, Stelzer G, Günzler B, Amati F, Conti E, Dallapiccola B, Hrabé de Angelis M, Novelli G, Meisterernst M (juni 2001). "Isolering och karakterisering av en ny gen från DiGeorge-kromosomregionen som kodar för en mediatorsubenhet". Genomik . 74 (3): 320–32. doi : 10.1006/geno.2001.6566 . PMID 11414760 .
Kato Y, Habas R, Katsuyama Y, Näär AM, He X (aug 2002). "En komponent av ARC/Mediator-komplexet som krävs för TGF beta/Nodal signalering". Naturen . 418 (6898): 641–6. Bibcode : 2002Natur.418..641K . doi : 10.1038/nature00969 . PMID 12167862 . S2CID 4330754 .
De Luca A, Conti E, Grifone N, Amati F, Spalletta G, Caltagirone C, Bonaviri G, Pasini A, Gennarelli M, Stefano B, Berti L, Mittler G, Meisterernst M, Dallapiccola B, Novelli G (Jan 2003). "Associationsstudie mellan CAG-trinukleotidupprepningar i PCQAP-genen (PC2-glutamin/Q-rikt associerat protein) och schizofreni". American Journal of Medical Genetics del B . 116B (1): 32–5. doi : 10.1002/ajmg.b.10008 . PMID 12497610 . S2CID 28657663 .
Zhang J, Liu L, Pfeifer GP (mars 2004). "Metylering av retinoidresponsgenen TIG1 i prostatacancer korrelerar med metylering av retinoinsyrareceptorns beta-gen" . Onkogen . 23 (12): 2241–9. doi : 10.1038/sj.onc.1207328 . PMID 14691453 .
Yang F, DeBeaumont R, Zhou S, Näär AM (feb 2004). "Den aktivator-rekryterade cofaktor/Mediator-koaktivatorsubenheten ARC92 är ett funktionellt viktigt mål för VP16-transkriptionsaktivatorn" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (8): 2339–44. Bibcode : 2004PNAS..101.2339Y . doi : 10.1073/pnas.0308676100 . PMC 356952 . PMID 14983011 .
Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (juni 2004). "En uppsättning konsensusdäggdjursmediatorsubenheter identifierade med multidimensionell proteinidentifieringsteknologi" . Molekylär cell . 14 (5): 685–91. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .
Sandhu HK, Hollenbeck N, Wassink TH, Philibert RA (sep 2004). "En associationsstudie av PCQAP-polymorfismer och schizofreni". Psykiatrisk genetik . 14 (3): 169–72. doi : 10.1097/00041444-200409000-00010 . PMID 15318033 . S2CID 45479038 .
Kwong J, Lo KW, Chow LS, Chan FL, To KF, Huang DP (januari 2005). "Tysta av retinoidresponsgenen TIG1 genom promotorhypermetylering i nasofarynxkarcinom". International Journal of Cancer . 113 (3): 386–92. doi : 10.1002/ijc.20593 . PMID 15455391 . S2CID 11628354 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "En genomannoteringsdriven metod för att klona det mänskliga ORFeome" . Genombiologi . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (maj 2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 .
Yang F, Vought BW, Satterlee JS, Walker AK, Jim Sun ZY, Watts JL, DeBeaumont R, Saito RM, Hyberts SG, Yang S, Macol C, Iyer L, Tjian R, van den Heuvel S, Hart AC, Wagner G , Näär AM (aug 2006). "En ARC/Mediator-subenhet krävs för SREBP-kontroll av kolesterol och lipidhomeostas". Naturen . 442 (7103): 700–4. Bibcode : 2006Natur.442..700Y . doi : 10.1038/nature04942 . PMID 16799563 . S2CID 4396081 .
Ishikawa H, Tachikawa H, Miura Y, Takahashi N (sep 2006). "TRIM11 binder till och destabiliserar en nyckelkomponent i det aktivatormedierade kofaktorkomplexet (ARC105) genom ubiquitin-proteasomsystemet" . FEBS Bokstäver . 580 (20): 4784–92. doi : 10.1016/j.febslet.2006.07.066 . PMID 16904669 .