| namn |
Beskrivning |
OS |
Licens |
Webbplats |
|
BioTapestry
|
interaktivt verktyg för att bygga, visualisera och simulera genetiska regulatoriska nätverk |
multiplattform (Java-baserad) |
LGPL |
[8]
|
|
Cytoscape
|
dataintegration, nätverksvisualisering och analys |
multiplattform (Java-baserad) |
LGPL |
[9]
|
|
GenMAPP
|
visualisera och analysera genomiska data i samband med vägar |
Windows |
Apache-licens |
[10]
|
|
MATLAB
|
verktyg för att modellera, simulera och analysera dynamiska biologiska system |
Windows, Linux, macOS |
Proprietär |
[11]
|
|
MEGA
|
gratis, online, öppen källkod, fylogenetisk analys, ritning av dendrogram etc. |
Windows/DOS-Win/Mac/Linux |
Shareware |
[12]
|
|
PathVisio
|
verktyg för att visa och redigera biologiska vägar |
multiplattform (Java-baserad) |
Apache-licens |
[13]
|
| InCroMAP |
verktyg för integrering av omics-data och gemensam visualisering av experimentella data i vägar |
multiplattform (Java-baserad) |
LGPL |
[14]
|
| Pathview |
vägbaserad dataintegration och visualisering, lätt att använda och integrera i väganalys |
multiplattform (R/Bioconductor) |
GPL |
[15] [16]
|
| SBMLDiagram |
Python API för att visa och redigera SBML-layout/renderingstillägg |
multiplattform |
MIT |
[17]
|
|
Systrip
|
analys av tidsseriedata i samband med biologiska nätverk |
Windows , Linux
|
LGPL , GPL
|
[18]
|