PathVisio
 | |
| Initial release | 2008 |
|---|---|
| Stabil frisättning | 3.3.0 / 28 januari 2018 |
| Förvar | |
| Skrivet i | Java |
| Operativ system | Alla ( Java -baserade) |
| Typ | Redigering, analys, visualisering av vägar |
| Licens | Apache 2.0 |
| Hemsida | |
PathVisio är ett gratis program för analys och ritning av vägar med öppen källkod. Det gör det möjligt att rita, redigera och analysera biologiska vägar . Visualisering av sina experimentella data om vägarna för att hitta relevanta vägar som är överrepresenterade i din datamängd är möjlig.
PathVisio tillhandahåller en grundläggande uppsättning funktioner för vägritning, analys och visualisering. Ytterligare funktioner är tillgängliga som plugins.
Historia
PathVisio skapades främst vid Maastricht University och Gladstone Institutes . Mjukvaran är utvecklad i Java och den används också som en del av WikiPathways ramverk som en applet. Från och med version 3.0 (släpptes 2012) är plugins OSGi- kompatibla och en pluginkatalog som beskriver dem utvecklades. 2015 släpptes version 3.2. Detta var den första signerade versionen med ett certifikat utfärdat av en certifieringsmyndighet. Många av de löpande problemen som introducerades av java 1.7 och 1.8 med de nya säkerhetsreglerna löstes. Sedan 2013 utvecklas en javascript-version (PVJS) för att ersätta appleten. Från 2015 tillåter det även små redigeringar och i framtiden kommer det att vara en fullständig redaktör.
Funktioner
- Vägritning och anteckning
- Väganalys
- Integration med WikiPathways för enkel redigering/publicering
- Integration med Cytoscape
- Integration med andra programmeringsspråk via PathVisioRPC