Lista över genetiska koder
Även om det finns mycket gemensamt, använder olika delar av livets träd lite olika genetiska koder . När man översätter från genom till protein är användningen av den korrekta genetiska koden väsentlig. De mitokondriella koderna är de relativt välkända exemplen på variation. Översättningstabelllistan nedan följer numreringen och beteckningen av NCBI.
- Standardkoden _
- Ryggradsdjurets mitokondriella kod
- Jästens mitokondriella kod
- Mögel- , protozo- och coelenterat mitokondriell kod och mykoplasma/spiroplasmakoden
- Den ryggradslösa mitokondriella koden
- Ciliat , dasycladacean och hexamita kärnkraftskod
- Kinetoplastkoden ; _ jfr . tabell 4.
- jfr . bord 1.
- Tagghudingen och plattmaskens mitokondriella kod
- Euplotid kärnkraftskod
- Bakterie- , arkeal- och växtplastidkoden
- Den alternativa kärnkraftskoden för jäst
- Den ascidiska mitokondriella koden
- Den alternativa plattmaskens mitokondriella kod
- Blepharisma kärnkraftskod _
- Den klorofykiska mitokondriella koden
- Trematodens mitokondriella kod
- Scenedesmus obliquus mitokondriella kod
- Thraustochytrium mitokondriella kod
- Pterobranchia mitokondriella kod
- Kandidatdivisionen SR1 och gracilibacteria kod
- Pachysolen tannophilus kärnkraftskod
- Den karyoraliska kärnkraftskoden
- Condylostoma kärnkraftskod _
- Mesodinium kärnkraftskod _
- Peritrichs kärnkraftskod
- Blastocrithidia kärnkraftskod _
- Balanophoraceae plastidkoden
- Cephalodiscidae mitokondriella kod
De alternativa translationstabellerna (2 till 33) involverar kodonomtilldelningar som återskapas i listan över alla kända alternativa kodoner .
Tabellöversikt
Jämförelse av alternativa översättningstabeller för alla kodoner (med IUPAC-aminosyrakoder) :
Aminosyra biokemiska egenskaper | Opolär | Polär | Grundläggande | Surt | Uppsägning: stoppkodon * |
Codon | Översättningstabell-ID (se ovan) | ||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | |
TTT | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
TTC | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
TTA | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | * | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
TTG | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
TCT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCA | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | * | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCG | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TAT | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
TAC | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
TAA | * | * | * | * | * | F | * | * | * | * | * | Y | * | * | * | * | * | * | * | * | F | F | Y | E | E | * | Y |
MÄRKA | * | * | * | * | * | F | * | * | * | * | * | * | F | L | * | L | * | * | * | * | F | F | Y | E | E | W | * |
TGT | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C |
TGC | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C |
TGA | * | W | W | W | W | * | W | C | * | * | W | W | * | * | W | * | * | W | G | * | W | W | * | * | W | * | W |
TGG | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W |
CTT | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTC | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTA | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTG | L | L | T | L | L | L | L | L | L | S | L | L | L | L | L | L | L | L | L | A | L | L | L | L | L | L | L |
CCT | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
CCC | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
CCA | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
CCG | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
KATT | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H |
CAC | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H |
CAA | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
CAG | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
CGT | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGC | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGA | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGG | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
ATT | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag |
ATC | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag |
ATA | jag | M | M | jag | M | jag | jag | jag | jag | jag | M | jag | jag | jag | M | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag | jag |
ATG | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M | M |
SPELA TEATER | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACC | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACA | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACG | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
AAT | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N |
AAC | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N | N |
AAA | K | K | K | K | K | K | N | K | K | K | K | N | K | K | N | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K |
AAG | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K |
AGT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
AGC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
AGA | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | G | S | R | R | S | R | R | S | R | R | R | R | R | R | R | R | S |
AGG | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | G | S | R | R | S | R | R | K | R | R | R | R | R | R | R | R | K |
GTT | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTC | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTA | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTG | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GCT | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCC | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCA | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCG | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GAT | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D |
GAC | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D |
GAA | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E |
GAG | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E | E |
GGT | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G |
GGC | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G |
GGA | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G |
GGG | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G |
Anteckningar
Tre översättningstabeller har en speciell status:
- Tabell 7 är nu sammanfogad med översättningstabell 4.
- Tabell 8 slås samman med tabell 1; alla växtkloroplastskillnader på grund av RNA-redigering.
- Tabell 15 är raderad i källan men ingår här för fullständighetens skull.
Andra mekanismer spelar också en roll i proteinbiosyntesen , såsom post-transkriptionell modifiering .
Se även
externa länkar
Vidare läsning
- Stefanie Gabriele Sammet; Ugo Bastolla & Markus Porto (14 juni 2010). "Jämförelse av översättningsbelastningar för standard- och alternativa genetiska koder" . BMC Evol Biol . 10 (178): 178. doi : 10.1186/1471-2148-10-178 . PMC 2909233 . PMID 20546599 .
-
Liliana Torcoroma García; Ney Ribeiro Leite; Juan D Alfonzo; Otavio Henrique Thiemann (31 juli 2007). "Effekter av Trypanosoma brucei tryptofanyl-tRNA-syntetaser som tystar genom RNA-interferens" . Mem. Inst. Oswaldo Cruz . Rio de Janeiro. 102 (6).
{{ citera journal }}
: CS1 underhåll: använder författarens parameter ( länk )