Lacrimispora indolis
| Lacrimispora indolis | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Bacillota |
| Klass: | Clostridia |
| Beställa: | Eubacteriales |
| Familj: | Lachnospiraceae |
| Släkte: | Lacrimispora |
| Arter: |
L. indolis
|
| Binomialt namn | |
|
Lacrimispora indolis (McClung och McCoy 1957) Haas och Blanchard 2020
|
|
| Synonymer | |
|
|
Lacrimispora indolis är en grampositiv , rörlig , anaerob , stavformad bakterie som producerar terminala sporer . Lacrimispora indolis namngavs ursprungligen för sin förmåga att hydrolysera tryptofan till indol, pyruvat och ammoniak i det klassiska indoltestet som används för att särskilja bakteriearter. Det finns vanligtvis i jord och kan hittas i avföring från människor och fåglar. Kolonier av Clostridium indolis visar sig vara icke-hemolytiska och har en optimal tillväxttemperatur på 37 °C, vilket klassificerar dem som mesofiler .
Morfologi
Lacrimispora indolis är grampositiva , stavformade bakterier som förekommer ensamma eller i par. Den har motilitet på grund av dess peritrichous flagella . Den producerar runda till ovala, svullna, terminala eller subterminala sporer . C. indolis är anaerob , vilket betyder att den inte kräver syre. Den är också en mesofil och växer bäst vid 37 °C.
Vid utplätering av C. indolis på blodagar fann man att de var icke-hemolytiska. Morfologin hos kolonierna registrerades som oregelbunden, konvex, genomskinlig till ogenomskinlig, vit, matt granulär yta och en hel att erodera marginal.
Genom
Genomet hos C. indolis DSM 775 innehåller 6 383 701 bp i sin cirkulära kromosom med en GC-halt på 44,93 % . Vid sekvensering av genomet fann man att det innehåller ett överflöd av gener i funktionella grupper associerade med transport och användning av kolhydrater. Genomet kodar för 910 gener, inklusive glykosidhydrolaser , med potential att bryta ner komplexa kolhydrater.
En häpnadsväckande 8% av proteinkodande gener är relaterade till kolhydrattransport i C. indolis . Dessa gener är placerade i två olika kategorier: ABC- transportörer (ATP-bindande kassett) och PTS-transportörer (fosfotransferassystem). ABC-transportörer bär i allmänhet oligosackarider och har låg affinitet för hexos . PTS-transportörer bär en mängd olika monosackarider och disackarider och har hög affinitet för hexos . C. indolis innehåller en större mängd PTS-transportörer, som tros vara fördelaktiga i kolhydratbegränsade miljöer.
C. indolis innehåller också 261 gener relaterade till energiproduktion och omvandling. Bland dessa finns gener för citratanvändning , laktatanvändning och kvävefixering .
Ekologi
C. indolis isoleras vanligtvis från jord såväl som avföring från människor och fåglar. Det är förknippat med infektioner i tarmkanalen.
Läkemedelskänslighet
| Läkemedelsnamn: |
|---|
| Amoxicillin/klavulanat |
| Ampicillin |
| Bacampicillin |
| Clindamycin |
| Dalbavancin |
| Doripenem |
| Ertapenem |
| Imipenem |
| Lincomycin |
| Linezolid |
| Meropenem |
| Metronidazol |
| Nitazoxanid |
| Penicillin |
| Piperacillin/tazobactam |
| Pristinamycin |
| Quinupristin-Dalfopristin |
| Telfopristin |
| Tecyklin |
| -Telfoscin |
| Telfloxin |