L-serin ammoniak-lyas
L -serin ammoniak-lyas | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifiers | |||||||||
EG nr. | 4.3.1.17 | ||||||||
Databaser | |||||||||
IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
KEGG | KEGG inträde | ||||||||
MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Enzymet L -serin ammoniak-lyas (EC 4.3.1.17) katalyserar den kemiska reaktionen
-
L -serin = pyruvat + NH 3 (total reaktion)
- (1a) L -serin = 2-aminoprop-2-enoat + H 2 O
- (1b) 2-aminoprop-2-enoat = 2-iminopropanoat (spontant)
- (1c) 2-iminopropanoat + H2O = pyruvat + NH3 ( spontant)
Detta enzym tillhör familjen lyaser , speciellt ammoniaklyaser, som klyver kol-kvävebindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är L -serin ammoniak-lyas (pyruvatbildande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar serindeaminas , L-hydroxiaminosyradehydratas , L -serindeaminas , L -serindehydratas och L -serinhydrolyas (deaminerande) . Detta enzym deltar i glycin , serin , treonin och cysteinmetabolism . Den använder en kofaktor , pyridoxalfosfat .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 4 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1P5J , 1PWE , 1PWH och 2IQQ .
- Ramos F, Wiame JM (1982). "Förekomst av ett kataboliskt L -serin ( L -treonin) deaminas i Saccharomyces cerevisiae " . Eur. J. Biochem . 123 (3): 571–6. doi : 10.1111/j.1432-1033.1982.tb06570.x . PMID 7042346 .
- Simon D, Hoshino J, Kroger H (1973). " L -serin dehydratas från råttlever. Rening och vissa egenskaper". Biochim. Biophys. Acta . 321 (1): 361–8. doi : 10.1016/0005-2744(73)90091-0 . PMID 4750769 .
- Suda M, Nakagawa H (1971). " L -serin dehydratas (råttlever)". Metoder Enzymol . 17B : 346–351. doi : 10.1016/0076-6879(71)17060-7 .
- Sagers RD, Carter JE (1971). " L -serin dehydratas ( Clostridium acidiurica) ". Metoder Enzymol . 17B : 351–356. doi : 10.1016/0076-6879(71)17061-9 .
- Robinson WG, Labow R (1971). " L -serin dehydratas ( Escherichia coli) ". Metoder Enzymol . 17B : 356–360. doi : 10.1016/0076-6879(71)17062-0 .