Kallchockdomän

CSD-
PDB 1h95 EBI.jpg
lösningsstruktur för den enkelsträngade dna-bindande kallchockdomänen (csd) av humant y-boxprotein 1 (yb1) bestämt av nmr (10 lägsta energistrukturer)
Identifierare
Symbol CSD
Pfam PF00313
Pfam klan CL0021
InterPro IPR002059
PROSITE PDOC00304
SCOP2 1mjc / SCOPe / SUPFAM
CDD cd04458
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är cold-shock-domänen ( CSD ) en proteindomän med cirka 70 aminosyror som har hittats i prokaryota och eukaryota DNA - bindande proteiner . En del av denna domän är mycket lik det RNP-1 RNA -bindande motivet .

När Escherichia coli utsätts för ett temperaturfall från 37 till 10 grader Celsius uppstår en 4–5 timmars eftersläpningsfas, varefter tillväxten återupptas med en reducerad hastighet . Under lagfasen ökas uttrycket av cirka 13 proteiner, som innehåller köldchockdomäner, 2–10 gånger. Dessa så kallade " köldchock " -proteiner tros hjälpa cellen att överleva i temperaturer som är lägre än den optimala tillväxttemperaturen, till skillnad från värmechockproteiner , som hjälper cellen att överleva i temperaturer högre än det optimala, möjligen genom kondensering av kromosom och organisation av den prokaryota nukleoiden .

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR002059