Isopeptidas

Ett isopeptidas är ett proteasenzym som hydrolyserar isopeptidbindningar , eller amidbindningar som förekommer utanför huvudkedjan i en polypeptidkedja .

Vid proteinnedbrytning

förekommer i kopplingen av proteinaminosyrasidokedjor till proteiner såsom ubiquitin och SUMO i proteinnedbrytningsvägen . I eukaryoter är enzymer med isopeptidasaktivitet ofta involverade i denna väg; alla fem klasserna av deubikvitinerande enzymer har isopeptidasaktivitet. Exempel inkluderar Ulpl-peptidas och USP5 (tidigare känt som isopeptidas T).

Vid bearbetning av lassopeptider

Isopeptidaser har också identifierats i prokaryoter som uttrycker lassopeptider , eller peptider med en knuten konformation etablerad genom närvaron av en icke-huvudkedjekoppling mellan en sur aminosyra och peptidens N-terminal för att bilda knuten. (Vissa lassopeptider har också topologisk komplexitet som tillförs av disulfidbindningar .) Isopeptidasenzymer lineariserar peptiderna genom att klyva isopeptidbindningen.