Immunoglobulin tung konstant alfa 1

IGHA1-
identifierare
	, IgA1, immunoglobulin tung konstant alfa 1
externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa

Immunoglobulin tung konstant alfa 1 är en immunglobulingen med symbolen IGHA1 . Den kodar för ett konstant (C) segment av immunglobulin A tung kedja . Immunglobulin A är en antikropp som spelar en avgörande roll för immunfunktionen i slemhinnorna . IgA visar samma typiska struktur för andra antikroppsklasser, med två tunga kedjor och två lätta kedjor, och fyra distinkta domäner: en variabel region och tre variabla regioner. Som en huvudklass av immunglobuliner i kroppsutsöndringar spelar IgA en roll i att försvara sig mot infektion , såväl som att förhindra tillgången av främmande antigener till det immunologiska systemet.

Upptäckt

IGHA1 beskrevs först i detalj 1975, när den primära strukturen (aminosyrasekvensen) av IgA klargjordes genom sekvensering av tryptiska och kymotryptiska peptider. På liknande sätt bestämdes den primära sekvensen oberoende för alfa-2-kedjan av proteinet 1979. Kompletta nukleotidsekvenser för alfa-1 tunga kedjans konstanta region och de alleliska alfa-2 tunga kedjans regioner publicerades 1984 och visade generna ingick i tre exoner , som var och en kodar för en enda region av proteindomänen.

Genens plats

Generna som kodar för IGHA1 finns på human kromosom 14 . Sekvensen som kodar för IGHA1 är 1 497 nukleotider lång och finns mellan loci 105 707 168 och 105 708 664. Den annoterade kromosomplatsen anges också som 14q32.33.

Proteinstruktur

Ig alfa-1-kedjans C-region finns i den första av de konstanta regionerna av IgA och består av en aminosyrasekvens som är 353 rester lång. Den sekundära strukturen som finns inom denna region domineras av betasträngar , som definierar fyra antiparallella beta-ark . Dessa antiparallella beta-ark läggs sedan ihop för att bilda två beta-smörgåsar, en typisk tertiär struktur av immunoglobulinveckklassen. De två betabladen som utgör varje beta-smörgås är sammanfogade av en alfaspiral på ena sidan. Dessa alfa-helixar definierar bindningsstället för detta protein, med bindningsstället som innehåller en antiparallell betasträng på vardera sidan av helixen. Förutom bindningsställena är den motsatta sidan av beta-sandwichen ansluten av en serie slingor, som definierar ett hypervariabelt loopsystem, som kan ha en roll i att bestämma specificiteten för en interaktion mellan IgA och ett antigen.

Patologisk information

IGHA1 har varit inblandad i en kromosomavvikelse identifierad i multipelt myelomlinjer . Avvikelsen har identifierats som en translokationshändelse , där translokation mellan IGHA1 (finns på kromosom 14) och FCRL4 (gensekvensen som kodar för en hämmande receptor, som finns på kromosom 1) leder till produktionen av ett fusionsprotein .

Vidare läsning

Kerr MA (1990). "Strukturen och funktionen av mänskligt IgA" . Biochem. J . 271 (2): 285–96. doi : 10.1042/bj2710285 . PMC 1149552 . PMID 2241915 .
Putnam FW, Liu YS, Low TL (1979). "Primärstruktur av ett humant IgA1-immunoglobulin. IV. Streptokock-IgA1-proteas, digestion, Fab- och Fc-fragment och den fullständiga aminosyrasekvensen för den tunga alfa-1-kedjan" . J. Biol. Chem . 254 (8): 2865–74. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30153-9 . PMID 107164 .
Yang C, Kratzin H, Götz H, Hilschmann N (1980). "[Regel för antikroppsstruktur. Primär struktur av ett humant monoklonalt IgA-immunoglobulin (myelomprotein Tro). VII. Rening och karakterisering av disulfidbryggorna]". Hoppe-Seylers Z. Physiol. Chem . 360 (12): 1919–40. PMID 393607 .
Kratzin H, Altevogt P, Ruban E, et al. (1975). "[Den primära strukturen av ett monoklonalt IgA-immunoglobulin (IgA Tro.), II. Aminosyrasekvensen för H-kedjan, alfa-typ, undergrupp III; strukturen för den kompletta IgA-molekylen (författarens transl)]". Hoppe-Seylers Z. Physiol. Chem . 356 (8): 1337–42. PMID 809331 .
Flanagan JG, Lefranc MP, Rabbitts TH (1984). "Mekanismer för divergens och konvergens av gensekvenserna för humana immunoglobulin alfa 1 och alfa 2 konstant region". Cell . 36 (3): 681–8. doi : 10.1016/0092-8674(84)90348-9 . PMID 6421489 . S2CID 54312675 .
Takahashi N, Ueda S, Obata M, et al. (1982). "Struktur av humana immunglobulin gamma-gener: implikationer för utvecklingen av en genfamilj". Cell . 29 (2): 671–9. doi : 10.1016/0092-8674(82)90183-0 . PMID 6811139 . S2CID 31733882 .
Calero M, Escribano J, Grubb A, Méndez E (1994). "Placering av en ny typ av interpolypeptidkedjekoppling i det humana proteinet HC-IgA-komplexet (HC-IgA) och identifiering av en heterogen kromofor associerad med komplexet" . J. Biol. Chem . 269 (1): 384–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42361-1 . PMID 7506257 .
Pleas RJ, Dunlop JI, Anderson CM, Woof JM (1999). "Identifiering av rester i CH2/CH3-domängränssnittet av IgA som är avgörande för interaktion med den humana fcalpha-receptorn (FcalphaR) CD89" . J. Biol. Chem . 274 (33): 23508–14. doi : 10.1074/jbc.274.33.23508 . PMID 10438530 .
McLean GR, Nakouzi A, Casadevall A, Green NS (2001). "Humana och murina immunglobulinexpressionsvektorkassetter". Mol. Immunol . 37 (14): 837–45. doi : 10.1016/S0161-5890(00)00101-2 . PMID 11257305 .
Gala FA, Morrison SL (2002). "Rollen av konstant region kolhydrat i montering och utsöndring av humant IgD och IgA1" . J. Biol. Chem . 277 (32): 29005–11. doi : 10.1074/jbc.M203258200 . PMID 12023968 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Kristiansen TZ, Bunkenborg J, Grönborg M, et al. (2005). "En proteomisk analys av mänsklig galla" . Mol. Cell. Proteomik . 3 (7): 715–28. doi : 10.1074/mcp.M400015-MCP200 . PMID 15084671 .
Senior BW, Woof JM (2005). "Effekten av mutationer i humant immunglobulin A1 (IgA1) beror på dess känslighet för klyvning av olika bakteriella IgA1-proteaser" . Infektera. Immun . 73 (3): 1515–22. doi : 10.1128/IAI.73.3.1515-1522.2005 . PMC 1064975 . PMID 15731049 .
Wines BD, Willoughby N, Fraser JD, Hogarth PM (2006). "En konkurrensmekanism för stafylokocktoxin SSL7 som hämmar leukocyt-IgA-receptorn, Fc alphaRI, avslöjas genom SSL7-bindning vid C alpha2/C alpha3-gränssnittet av IgA. " J. Biol. Chem . 281 (3): 1389–93. doi : 10.1074/jbc.M509334200 . PMID 16293625 .
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). "Signalsekvens och nyckelordsfälla i silico för urval av fullängds humana cDNA som kodar för sekretion eller membranproteiner från oligokapslade cDNA-bibliotek" . DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
Almogren A, Furtado PB, Sun Z, et al. (2006). "Rening, egenskaper och utökad lösningsstruktur av komplexet som bildas mellan humant immunglobulin A1 och humant serumalbumin genom spridning och ultracentrifugering". J. Mol. Biol . 356 (2): 413–31. doi : 10.1016/j.jmb.2005.11.060 . PMID 16376934 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Geng LY, Shi ZZ, Dong Q, et al. (2007). "Uttryck av SNC73, ett transkript av immunoglobulin alfa-1-genen, i humana epiteliala karcinom" . World J. Gastroenterol . 13 (16): 2305–11. doi : 10.3748/wjg.v13.i16.2305 . PMC 4147138 . PMID 17511028 .