Hypervariabel region

En hypervariabel region ( HVR ) är en plats inom kärn-DNA eller D-slingan av mitokondriellt DNA där baspar av nukleotider upprepas (i fallet med nukleärt DNA) eller har substitutioner (i fallet med mitokondriellt DNA). Förändringar eller upprepningar i den hypervariabla regionen är mycket polymorfa .

Mitokondrie

Humant mitokondriegenom som visar hypervariabla regioner I till III (gröna rutor) belägna i kontrollregionen (CR; grå ruta).

Det finns två MITOKONDRIELLA hypervariabla regioner som används i human mitokondriell genealogisk DNA-testning . HVR1 anses vara en "lågupplöst" region och HVR2 anses vara en "högupplöst" region. Att få HVR1 och HVR2 DNA-tester kan hjälpa till att bestämma ens haplogrupp . I den reviderade Cambridge Reference Sequence of the human mitogenome, är de mest variabla platserna för HVR1 numrerade 16024-16383 (denna undersekvens kallas HVR-I), och de mest variabla platserna för HVR2 är numrerade 57-372 (dvs HVR -II och 438-574 ( dvs HVR-III).

Hos vissa benfiskar , till exempel vissa Protacanthopterygii och Gadidae , utvecklas den mitokondriella kontrollregionen anmärkningsvärt långsamt. Även funktionella mitokondriella gener ackumulerar mutationer snabbare och mer fritt. Det är inte känt om sådana hypovariabla kontrollregioner är mer utbredda. Hos Ayu ( Plekoglossus altivelis ), en östasiatisk protacantopterygian, är kontrollregionens mutationshastighet inte markant sänkt, men sekvensskillnaderna mellan underarter är mycket lägre i kontrollregionen än på andra ställen. Detta fenomen trotsar helt förklaringen för närvarande.

Antikroppar

I antikroppar bildar hypervariabla regioner det antigenbindande stället och finns på både lätta och tunga kedjor . De bidrar också till specificiteten hos varje antikropp. I en variabel domän viker de 3 HV- _segmenten av varje tung eller lätt kedja ihop vid N-terminalen för att bilda en antigenbindande ficka. ^{[ citat behövs ]}

Se även

externa länkar

Hypervariabel+region vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
DNA: Forensiska och juridiska tillämpningar, förklaring av hypervariabla regioner