Human Cell Atlas

Human Cell Atlas
Innehåll
Organismer Mänsklig
Tillgång
Hemsida www .humancellatlas .org

Human Cell Atlas är ett projekt för att beskriva alla celltyper i människokroppen . Initiativet tillkännagavs av ett konsortium efter sitt inledande möte i London i oktober 2016, som etablerade den första fasen av projektet. Aviv Regev och Sarah Teichmann definierade målen för projektet vid det mötet, som sammankallades av Broad Institute , Wellcome Trust Sanger Institute och Wellcome Trust . Regev och Teichmann leder projektet.

Beskrivning

Human Cell Atlas kommer att katalogisera en cell baserat på flera kriterier, specifikt celltypen , dess tillstånd, dess plats i kroppen, övergångarna den genomgår och dess härkomst. Den kommer att samla in data från befintlig forskning och integrera den med data som samlas in i framtida forskningsprojekt. Bland de data som kommer att samlas in är fluxomet , genomet , metabolomet , proteomet och transkriptomet .

Dess räckvidd är att kategorisera människokroppens 37 biljoner celler för att bestämma vilka gener varje cell uttrycker genom att ta prover på celler från alla delar av kroppen.

Alla aspekter av projektet kommer att göras "tillgängliga för allmänheten gratis", inklusive programvara och resultat.

I april 2018 omfattade projektet mer än 480 forskare som genomförde 185 projekt.

Finansiering

I oktober 2017 tillkännagav Chan Zuckerberg-initiativet finansiering för 38 projekt relaterade till Human Cell Atlas. Bland dem var ett anslag av hemligt värde till Zuckerman Institute vid Columbia University Medical Center vid Columbia University . Bidraget, med titeln "En strategi för kartläggning av den mänskliga ryggmärgen med singelcellsupplösning", kommer att finansiera forskning för att identifiera och katalogisera genaktivitet i alla ryggmärgsceller . Translational Genomics Research Institute fick ett anslag för att utveckla en standard för "bearbetning och lagring av fasta vävnader för encellig RNA-sekvensering ", jämfört med den typiska praxis att förlita sig på genomsnittet av sekvensering av flera celler. Projektets hemsidor är tillgängliga från https://www.czbiohub.org/tabula-projects/ .

Programmet stöds också av Europeiska unionen , National Institutes of Health i USA och Manton Foundation.

Data

I april 2018 släpptes den första datamängden från projektet, som representerar 530 000 immunsystemceller insamlade från benmärg och navelsträngsblod .

Ett forskningsprogram vid Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics publicerade en atlas över leverns celler, med encellig RNA-sekvensering på 10 000 normala celler erhållna från nio donatorer.

Tabula Sapeins data publicerades på en särskild webbplats

Se även

Anteckningar

Vidare läsning

externa länkar

Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Human_Cell_Atlas&oldid=1136199729 "