Haplogroup S-M230
| Haplogroup S-M230 (S1a1b) | |
|---|---|
 | |
| Möjlig ursprungstid | 28 000-41 000 år före nutid ( Scheinfeldt 2006 ) |
| Möjlig ursprungsort | Nya Guinea / Indonesien |
| Förfader | S1a1 (Z42413) |
| Ättlingar | S1a1b1 (M254) |
| Definiera mutationer | M230, P202 |
| Högsta frekvenser | Ekari 74% ( Mona 2007 ) |
Haplogroup S-M230 , även känd som S1a1b (och tidigare som S* eller K2b1a4), är en Y-kromosom-DNA-haplogrupp . Det är den överlägset mest numeriskt betydelsefulla undergruppen av Haplogroup S1a (och dess enda primära subclade, Haplogroup S-P405).
S-M230 är vanligt förekommande bland populationer i höglandet i Papua Nya Guinea ( Kayser 2003 ) . Den finns också vid lägre frekvenser i angränsande delar av Indonesien och Melanesien . ( Kayser 2003 Cox 2006 )
Ursprung
Distribution
En studie har rapporterat att haplogruppen S-M230 hittats i: 52 % (16/31) av ett prov från Papua Nya Guineas (PNG) högland; 21 % (7/34) av ett prov från Moluckerna ; 16 % (5/31) av ett prov från Papua Nya Guineas kust; 12,5 % (2/16) av ett urval av Tolai från New Britain ; 10 % (3/31) av ett prov från Nusa Tenggara , och; 2 % (2/89) av ett prov från västra Nya Guineas lågland/kust.( Kayser 2003 Cox 2006 )
En subclade, Haplogroup S-M226.1 (S1a1b1d1a; tidigare S1d) har hittats vid låga frekvenser på Admiralty Islands och längs kusten av fastlandet PNG. ( Kayser 2008 ) .
Fylogenetik
Struktur och position inom Haplogroup S
- Sla
- S1a1 Z42413
- S1a1a
- S1a1a1 P60, P304, P308
- S1a1a2
- S1a1b M230, P202, P204 – "degraderad" 2016 från sin tidigare position som basal Haplogroup S* (och tidigare känd som Haplogroup K5)
- S1a1b1 (M254) (tidigare känd som K2b1a4a)
- S1a1b1 (M254)
- S1a1b1a (P57)
- S1a1b1b (P61)
- S1a1b1c (P83)
- S1a1b1d (SK1891)
- S1a1a
- S1a2 P79, P307
- S1a3 P315
- S1a3a Z41763
- S1a3b~ P401
- (Baserat på 2017 ISOGG- trädet, 2015 ISOGG -trädet) 2008 års YCC- träd ( Karafet 2008 ) och annan publicerad forskning.)
Historia
Före 2002 fanns det i den akademiska litteraturen minst sju namnsystem för Y-kromosomens fylogenetiska träd. Detta ledde till stor förvirring. 2002 gick de stora forskargrupperna samman och bildade Y-kromosomkonsortiet (YCC) . De publicerade ett gemensamt dokument som skapade ett enda nytt träd som alla gick med på att använda. Senare bildade en grupp medborgarforskare med intresse för populationsgenetik och genetisk genealogi en arbetsgrupp för att skapa ett amatörträd som framför allt syftar till att komma i rätt tid. Tabellen nedan samlar alla dessa verk vid punkten av det landmärke 2002 YCC-trädet. Detta gör att en forskare som granskar äldre publicerad litteratur snabbt kan flytta mellan nomenklaturer.
| YCC 2002/2008 (Shorthand) | (α) | (β) | (γ) | (δ) | (ε) | (ζ) | (η) | YCC 2002 (Longhand) | YCC 2005 (Longhand) | YCC 2008 (Longhand) | YCC 2010r (Longhand) | ISOGG 2006 | ISOGG 2007 | ISOGG 2008 | ISOGG 2009 | ISOGG 2010 | ISOGG 2011 | ISOGG 2012 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| K-M9 | 26 | VIII | 1U | 25 | Eu16 | H5 | F | K* | K | K | K | - | - | - | - | - | - | - |
Forskningspublikationer
Följande forskargrupper per deras publikationer var representerade i skapandet av YCC-trädet.
- α Jobling och Tyler-Smith 2000 och Kaladjieva 2001
- β Underhill 2000
- γ Hammer 2001
- δ Karafet 2001
- Semino 2000
- ζ Sön 1999
- η Capelli 2001
2005 YCC-träd
2008 YCC-träd
Från 2002 till 2008 var den känd som Haplogroup K5 . [ citat behövs ]
Se även
Genetik
Y-DNA S-underlag
- S-M230
Y-DNA ryggradsträd
Fotnoter
Anförda verk
- Cox, Murray P.; Mirazón Lahr, Marta (2006). "Y-kromosommångfald är omvänt associerad med språktillhörighet i parade austronesisk- och papuansktalande samhällen från Salomonöarna". American Journal of Human Biology . 18 (1): 35–50. doi : 10.1002/ajhb.20459 . PMID 16378340 . S2CID 4824401 .
- Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008). "Nya binära polymorfismer omformar och ökar upplösningen av det mänskliga Y-kromosomala haplogruppsträdet" . Genomforskning . 18 (5): 830–8. doi : 10.1101/gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .
- Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). "Reducerad Y-kromosom, men inte mitokondriellt DNA, mångfald i mänskliga populationer från västra Nya Guinea" . American Journal of Human Genetics . 72 (2): 281–302. doi : 10.1086/346065 . PMC 379223 . PMID 12532283 .
- Kayser, M.; Choi, Y.; Van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, RJ; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W.; Stoneking, M. (2008). "Effekten av den austronesiska expansionen: bevis från mtDNA och Y-kromosommångfald på amiralitetsöarna i Melanesia" . Molekylärbiologi och evolution . 25 (7): 1362–74. doi : 10.1093/molbev/msn078 . PMID 18390477 .
- Mona, S.; Tommaseo-Ponzetta, M.; Brauer, S.; Sudoyo, H.; Marzuki, S.; Kayser, M. (2007). "Mönster av Y-kromosommångfald korsar hypotesen Trans-New Guinea" . Mol. Biol. Evol . 24 (11): 2546–55. doi : 10.1093/molbev/msm187 . PMID 17846104 .
- Scheinfeldt, L.; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). "Oväntad NRY-kromosomvariation i Northern Island Melanesia" . Molekylärbiologi och evolution . 23 (8): 1628–41. doi : 10.1093/molbev/msl028 . PMID 16754639 .
Källor för konverteringstabeller
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (februari 2001). "Ett övervägande inhemskt faderligt arv för de austronesisktalande folken i öarna i Sydostasien och Oceanien" . American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–443. doi : 10.1086/318205 . PMC 1235276 . PMID 11170891 .
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd, Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (1 juli 2001). "Hierarkiska mönster av global mänsklig Y-kromosommångfald" . Molekylärbiologi och evolution . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID 11420360 .
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000), "New uses for new haplotypes", Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
- Kaladjieva, Luba; Calafell, Francesc; Jobling, Mark A; Angelicheva, Dora; et al. (februari 2001). "Mönster av genetisk mångfald mellan och inom gruppen i Vlax Roma som avslöjats av Y-kromosomer och mitokondriella DNA-linjer" . European Journal of Human Genetics . 9 (2): 97–104. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID 11313742 . S2CID 21432405 .
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (september 2001). "Paternal Population History of East Asia: Källor, mönster och mikroevolutionära processer" . American Journal of Human Genetics . 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490 . PMID 11481588 .
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), "The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: AY Chromosome Perspective", Science , 290 (5494): 1155–9, Bibcode : 2000Sci...290.1155S , doi : 6.419.4190/10.419. 1155 , PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (december 1999). "Y-kromosombevis för en nordlig migration av moderna människor till östra Asien under den senaste istiden" . American Journal of Human Genetics . 65 (6): 1718–1724. doi : 10.1086/302680 . PMC 1288383 . PMID 10577926 .
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (november 2000). "Y-kromosomsekvensvariation och mänskliga populationers historia". Naturgenetik . 26 (3): 358–361. doi : 10.1038/81685 . PMID 11062480 . S2CID 12893406 .
Vidare läsning
- Haber, Marc; Platt, Daniel E.; Ashrafian Bonab, Maziar; Youhanna, Sonia C.; Soria-Hernanz, David F.; Martínez-Cruz, Begoña; Douaihy, Bouchra; Ghassibe-Sabbagh, Michella; et al. (2012). Kayser, Manfred (red.). "Afghanistans etniska grupper delar ett Y-kromosomalt arv strukturerat av historiska händelser" . PLOS ETT . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO...734288H . doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552 .
- Karafet, Tatiana M.; Lansing, JS; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, SPK; Arthawiguna, WA; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; et al. (2005). "Balinesiskt Y-kromosomperspektiv på befolkningen i Indonesien: Genetiska bidrag från förneolitiska jägare-samlare, austronesiska bönder och indiska handlare". Människans biologi . 77 (1): 93–114. doi : 10.1353/hub.2005.0030 . hdl : 1808/13586 . PMID 16114819 . S2CID 7953854 .
- Kayser, M.; Brauer, S; Cordaux, R; Casto, A; Lao, O; Zhivotovsky, LA; Moyse-Faurie, C; Rutledge, RB; et al. (2006). "Melanesiska och asiatiska ursprung av polynesier: MtDNA- och Y-kromosomgradienter över Stilla havet" . Molekylärbiologi och evolution . 23 (11): 2234–44. doi : 10.1093/molbev/msl093 . PMID 16923821 .