HTATSF1

HTATSF1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, TAT-SF1, TATSF1, dJ196E23.2, HIV-1 Tat-specifik faktor 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

HIV Tat-specifik faktor 1 är ett protein som hos människor kodas av HTATSF1 -genen .

Fungera

Medan de flesta DNA-sekvensspecifika transkriptionsfaktorer ökar initieringshastigheten och interagerar med förstärkar- eller promotor-DNA, stimulerar humant immunbristvirus-1 (HIV-1) Tat övervägande förlängning och interagerar med det transagerande responsiva (TAR) RNA-elementet. Tat är avgörande för HIV-replikation.

HTATSF1 har också visat sig vara involverad i intronretention och är associerad med splitsning av mRNA som kodar för ribosomala proteiner. Det är också associerat med ett naivt pluripotent tillstånd, även om förhållandet är komplext och starkt påverkat av andra pluripotensfaktorer som Nanog och KLF2 .

Interaktioner

HTATSF1 har visats interagera med SUPT5H och GTF2F2 .

Vidare läsning

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Zhou Q, Chen D, Pierstorff E, Luo K (1998). "Transkriptionsförlängningsfaktor P-TEFb förmedlar Tat-aktivering av HIV-1-transkription i flera stadier" . EMBO J . 17 (13): 3681–91. doi : 10.1093/emboj/17.13.3681 . PMC 1170704 . PMID 9649438 .
Yan D, Perriman R, Igel H, et al. (1998). "CUS2, en jästhomolog av human Tat-SF1, räddar funktionen av felvikt U2 genom ett ovanligt RNA-igenkänningsmotiv" . Mol. Cell. Biol . 18 (9): 5000–9. doi : 10.1128/MCB.18.9.5000 . PMC 109085 . PMID 9710584 .
Li XY, Green MR (1998). "HIV-1 Tat cellulära samaktivator Tat-SF1 är en allmän transkriptionsförlängningsfaktor" . Genes Dev . 12 (19): 2992–6. doi : 10.1101/gad.12.19.2992 . PMC 317190 . PMID 9765201 .
Parada CA, Roeder RG (1999). "Ett nytt RNA-polymeras II-innehållande komplex potentierar Tat-förstärkt HIV-1-transkription" . EMBO J . 18 (13): 3688–701. doi : 10.1093/emboj/18.13.3688 . PMC 1171446 . PMID 10393184 .
Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, et al. (1999). "Tat-SF1-protein associerar med RAP30 och humana SPT5-proteiner" . Mol. Cell. Biol . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462 . PMID 10454543 .
Fong YW, Zhou Q (2000). "Lättnad av två inbyggda autoinhibitoriska mekanismer i P-TEFb krävs för sammansättning av ett multikomponenttranskriptionsförlängningskomplex vid den humana immunbristvirus typ 1-promotorn. " Mol. Cell. Biol . 20 (16): 5897–907. doi : 10.1128/MCB.20.16.5897-5907.2000 . PMC 86067 . PMID 10913173 .
Suñé C, Goldstrohm AC, Peng J, et al. (2000). "Ett in vitro-transkriptionssystem som rekapitulerar infektiöst anemivirus från häst tat-medierad hämning av humant immunbristvirus typ 1 Tat-aktivitet visar en roll för positiv transkriptionsförlängningsfaktor b och associerade proteiner i mekanismen för Tat-aktivering. " Virologi . 274 (2): 356–66. doi : 10.1006/viro.2000.0480 . PMID 10964778 .
Simmons A, Aluvihare V, McMichael A (2001). "Nef utlöser ett transkriptionsprogram i T-celler som imiterar enkelsignals T-cellsaktivering och inducerar HIV-virulensmediatorer" . Immunitet . 14 (6): 763–77. doi : 10.1016/S1074-7613(01)00158-3 . PMID 11420046 .
Fong YW, Zhou Q (2002). "Stimulerande effekt av splitsningsfaktorer på transkriptionell förlängning". Naturen . 414 (6866): 929–33. doi : 10.1038/414929a . PMID 11780068 . S2CID 1518837 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds-cDNA-sekvenser för människor och mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Zhou BY, He JJ (2004). "Proliferationshämning av astrocyter, neuroner och icke-gliaceller av intracellulärt uttryckt humant immunbristvirus typ 1 (HIV-1) Tat-protein". Neurosci. Lett . 359 (3): 155–8. doi : 10.1016/j.neulet.2004.02.012 . PMID 15050687 . S2CID 3048557 .
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2005). "Fosfoproteomisk analys av den utvecklande mushjärnan" . Mol. Cell. Proteomik . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
Smith MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). "FF-domäner av CA150 binder transkriptions- och splitsningsfaktorer genom flera svaga interaktioner" . Mol. Cell. Biol . 24 (21): 9274–85. doi : 10.1128/MCB.24.21.9274-9285.2004 . PMC 522232 . PMID 15485897 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Zhou M, Deng L, Lacoste V, et al. (2004). "Koordinering av transkriptionsfaktorfosforylering och histonmetylering av P-TEFb-kinas under transkription av humant immunbristvirus typ 1" . J. Virol . 78 (24): 13522–33. doi : 10.1128/JVI.78.24.13522-13533.2004 . PMC 533906 . PMID 15564463 .
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ, et al. (2005). "DNA-sekvensen av den mänskliga X-kromosomen" . Naturen . 434 (7031): 325–37. Bibcode : 2005Natur.434..325R . doi : 10.1038/nature03440 . PMC 2665286 . PMID 15772651 .
Missé D, Gajardo J, Oblet C, et al. (2005). "Lösligt HIV-1 gp120 förbättrar HIV-1-replikationen i icke-delande CD4+ T-celler, medierad via cellsignalering och Tat-kofaktoröveruttryck" . AIDS . 19 (9): 897–905. doi : 10.1097/01.aids.0000171403.07995.92 . PMID 15905670 . S2CID 23688259 .