Gen för histon H3.3-protein
H3-3A
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, H3.3A, H3F3, H3 histon, familj 3A, H3 histon familjemedlem 3A, H3.3 histon A, H3F3A, H3-3B
Externa ID :n
Wikidata
Histon H3.3 är ett protein som hos människor kodas av generna H3F3A och H3F3B . Det spelar en viktig roll för att upprätthålla genomets integritet under utvecklingen av däggdjur.
Histoner är grundläggande kärnproteiner som är ansvariga för nukleosomstrukturen hos kromosomfibrerna i eukaryoter. Två molekyler av var och en av de fyra kärnhistonerna (H2A, H2B, H3 och H4) bildar en oktamer, runt vilken cirka 146 bp DNA är insvept i upprepade enheter, kallade nukleosomer. Linkerhistonen, H1, interagerar med linker-DNA mellan nukleosomer och fungerar i komprimeringen av kromatin till strukturer av högre ordning. Denna gen innehåller introner och dess mRNA är polyadenylerat, till skillnad från de flesta histongener. Proteinet som kodas är en replikationsoberoende medlem av histon H3-familjen.
Mutationer av H3F3A är också kopplade till vissa cancerformer. p.Lys27Met upptäcktes i Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG), där de är närvarande i 65-75 % av tumörerna och ger en sämre prognos. p.Lys27Met förändringar i HIST1H3B och HIST1H3C , som kodar för histon H3.1 har också rapporterats i ~10% av DIPG. H3F3A är också muterad i en mindre del av höggradiga astrocytom hos pediatriska och unga vuxna , men oftare som p.Gly34Arg/Val. Mutationer i H3F3A och H3F3B finns också i kondroblastom och jättecellstumör i ben .
Vidare läsning
Zhang Y, Reinberg D (september 2001). "Transkriptionsreglering genom histonmetylering: samspel mellan olika kovalenta modifieringar av kärnhistonsvansarna" . Gener & Utveckling . 15 (18): 2343–60. doi : 10.1101/gad.927301 . PMID 11562345 .
Wells D, Kedes L (maj 1985). "Struktur av ett humant histon cDNA: bevis för att basalt uttryckta histongener har mellanliggande sekvenser och kodar för polyadenylylerade mRNA. " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 82 (9): 2834–8. Bibcode : 1985PNAS...82.2834W . doi : 10.1073/pnas.82.9.2834 . PMC 397660 . PMID 2859593 .
Ohe Y, Iwai K (oktober 1981). "Human mjälte histon H3. Isolering och aminosyrasekvens". Journal of Biochemistry . 90 (4): 1205–11. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133573 . PMID 7309716 .
Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N, et al. (december 1994). "Konstruktion av en mänsklig cDNA-bank i full längd". Gene . 150 (2): 243–50. doi : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . PMID 7821789 .
Albig W, Bramlage B, Gruber K, Klobeck HG, Kunz J, Doenecke D (november 1995). "Den mänskliga ersättningshiston H3.3B-genen (H3F3B)". Genomik . 30 (2): 264–72. doi : 10.1006/geno.1995.9878 . PMID 8586426 .
Palaparti A, Baratz A, Stifani S (oktober 1997). "Den Groucho/transducinliknande förstärkaren av delade transkriptionsrepressorer interagerar med den genetiskt definierade aminoterminala tystnadsdomänen av histon H3" . Journal of Biological Chemistry . 272 (42): 26604–10. doi : 10.1074/jbc.272.42.26604 . PMID 9334241 .
Lin X, Wells DE (december 1997). "Lokalisering av den mänskliga H3F3A histongenen till 1q41, utanför de normala histongenklustren". Genomik . 46 (3): 526–8. doi : 10.1006/geno.1997.5037 . PMID 9441765 .
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (maj 1998). "Transkriptionell aktivering av den integrerade kromatinassocierade humana immunbristvirus typ 1-promotorn" . Molekylär och cellulär biologi . 18 (5): 2535–44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC 110633 . PMID 9566873 .
Goto H, Tomono Y, Ajiro K, Kosako H, Fujita M, Sakurai M, et al. (september 1999). "Identifiering av en ny fosforyleringsplats på histon H3 i kombination med mitotisk kromosomkondensation" . Journal of Biological Chemistry . 274 (36): 25543–9. doi : 10.1074/jbc.274.36.25543 . PMID 10464286 .
Lo WS, Trievel RC, Rojas JR, Duggan L, Hsu JY, Allis CD, et al. (juni 2000). "Fosforylering av serin 10 i histon H3 är funktionellt kopplad in vitro och in vivo till Gcn5-medierad acetylering vid lysin 14" . Molekylär cell . 5 (6): 917–26. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80257-9 . PMID 10911986 .
Deng L, de la Fuente C, Fu P, Wang L, Donnelly R, Wade JD, et al. (november 2000). "Acetylering av HIV-1 Tat av CBP/P300 ökar transkriptionen av integrerat HIV-1-genom och förbättrar bindningen till kärnhistoner" . Virologi . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID 11080476 .
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (mars 2001). "Metylering av histon H3 lysin 9 skapar ett bindningsställe för HP1-proteiner". Naturen . 410 (6824): 116–20. Bibcode : 2001Natur.410..116L . doi : 10.1038/35065132 . PMID 11242053 . S2CID 4331863 .
Zhong S, Zhang Y, Jansen C, Goto H, Inagaki M, Dong Z (april 2001). "MAP-kinaser förmedlar UVB-inducerad fosforylering av histon H3 vid serin 28" . Journal of Biological Chemistry . 276 (16): 12932–7. doi : 10.1074/jbc.M010931200 . PMID 11278789 .
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, et al. (oktober 2001). "Protein-proteininteraktionspanel som använder mus fullängds-cDNA" . Genomforskning . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
Deng L, Wang D, de la Fuente C, Wang L, Li H, Lee CG, et al. (oktober 2001). "Förbättring av p300 HAT-aktiviteten genom HIV-1 Tat på kromatin-DNA" . Virologi . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID 11689053 .
Bauer UM, Daujat S, Nielsen SJ, Nightingale K, Kouzarides T (januari 2002). "Metylering vid arginin 17 av histon H3 är kopplad till genaktivering" . EMBO-rapporter . 3 (1): 39–44. doi : 10.1093/embo-reports/kvf013 . PMC 1083932 . PMID 11751582 .
Zegerman P, Canas B, Pappin D, Kouzarides T (april 2002). "Histon H3 lysin 4-metylering stör bindningen av nukleosomremodellering och deacetylas (NuRD) repressorkomplex" . Journal of Biological Chemistry . 277 (14): 11621–4. doi : 10.1074/jbc.C200045200 . PMID 11850414 .
Goto H, Yasui Y, Nigg EA, Inagaki M (januari 2002). "Aurora-B fosforylerar histon H3 vid serine28 med avseende på den mitotiska kromosomkondensationen". Gener till celler . 7 (1): 11–7. doi : 10.1046/j.1356-9597.2001.00498.x . PMID 11856369 . S2CID 23717416 .
PDB galleri
1aoi : KOMPLEX MELLAN NUKLEOSOMKÄRNPARTIKEL (H3,H4,H2A,H2B) OCH 146 BP LÅNGT DNA-FRAGMENT
1eqz : RÖNTGENSTRUKTUR HOS NUKLEOSOMKÄRNPARTIKELN VID 2,5 A UPPLÖSNING
1f66 : 2.6 EN KRISTALSTRUKTUR AV EN NUKLEOSOMKÄRNPARTIKEL SOM INNEHÅLLER VARIANTHISTONEN H2A.Z
1hq3 : KRISTALSTRUKTUR HOS HISTONEKÄRNEOKTAMEREN I KCL/FOSFAT
1kx3 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP146, vid 2,0 A-upplösning
1kx4 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP146b, vid 2,6 A-upplösning
1kx5 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP147, vid 1,9 A-upplösning
1m18 : LIGANDBINDNING ÄNDRINGAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1m19 : LIGANDBINDNING ÄNDRINGAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1m1a : LIGANDBINDNING ÄNDRAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1p34 : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3a : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3b : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3f : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3g : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3i : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3k : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3l : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3m : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3o : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3p : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1s32 : Molekylär igenkänning av den nukleosomala "supergrooven"
1tzy : Kristallstruktur av Core-Histone Octamer till 1,90 Ångströms upplösning
1u35 : Kristallstruktur av nukleosomkärnpartikeln som innehåller histondomänen av macroH2A
1zbb : Struktur av 4_601_167 tetranukleosomen
1zla : Röntgenstruktur av en Kaposis sarkom herpesvirus LANA-peptid bunden till den nukleosomala kärnan
2aro : Kristallstruktur av den naturliga histonoktameren till 2,1 Ångströms upplösning, kristalliserad i närvaro av S-Nitrosoglutation
2cv5 : Kristallstruktur av mänsklig nukleosomkärnpartikel
2f8n : 2,9 Ångström röntgenstruktur av hybrid makroH2A nukleosomer
2fj7 : Kristallstruktur av nukleosomkärnpartikel som innehåller ett poly(dA.dT) sekvenselement
2hio : HISTONEOKTAMER (KYCKLING), KROMOSOMALT PROTEIN
2hue : Struktur av H3-H4 chaperonen Asf1 bunden till histonerna H3 och H4
2io5 : Kristallstruktur av CIA-histon H3-H4-komplexet
2nzd : Nukleosomkärnpartikel innehållande 145 bp DNA