Glykan array

Glykanmatriser , som de som erbjuds av Consortium for Functional Glycomics (CFG), National Center for Functional Glycomics (NCFG) och Z Biotech, LLC , innehåller kolhydratföreningar som kan screenas med lektiner, antikroppar eller cellreceptorer för att definiera kolhydratspecificitet och identifiera ligander. Glycan array screening fungerar på ungefär samma sätt som andra mikroarrayer som används till exempel för att studera genuttryck DNA mikroarrayer eller proteininteraktion Protein mikroarrayer .

Glykanmatriser är sammansatta av olika oligosackarider och/eller polysackarider immobiliserade på ett fast underlag i ett rumsligt definierat arrangemang. Denna teknik ger möjlighet att studera glykan-proteininteraktioner i en miljö med hög genomströmning. Dessa naturliga eller syntetiska (se kolhydratsyntes ) glykaner inkuberas sedan med vilket glykanbindande protein som helst som lektiner , cellytreceptorer eller möjligen en hel organism som ett virus . Bindning kvantifieras med fluorescensbaserade detektionsmetoder.

Ansökningar

Glykanarrayteknologin har använts och används fortfarande för att studera specificiteten hos värd-patogeninteraktioner .

Tidigt visade sig glykanmatriser vara användbara för att bestämma specificiteten hos hemagglutinin (influensa) hos influensa A-viruset som binder till värden och särskiljer mellan olika influensastammar (inklusive fågel från däggdjur). Detta visades med CFG-arrayer såväl som anpassade arrayer. Riktmärken över plattformar ledde till att belysa effekten av glykanpresentation och avstånd på bindning.

Glykanmatriser kombineras möjligen med andra tekniker såsom Surface Plasmon Resonance (SPR) för att förfina karakteriseringen av glykanbindning . Till exempel ledde denna kombination till att demonstrera den kalciumberoende heparinbindningen av Annexin A1 som är involverad i flera biologiska processer inklusive inflammation , apoptos och membranhandel .