Gla domän
| GLA-domänförankring | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 av koagulationsfaktor VIIa till membranet genom dess GLA-
| |||||||||
| domänidentifierare | |||||||||
| Symbol | Gla | ||||||||
| Pfam | PF00594 | ||||||||
| InterPro | IPR000294 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00011 | ||||||||
| SCOP2 | 1cfi / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamilj | 89 | ||||||||
| OPM-protein | 1pfx | ||||||||
| Membran | 342 | ||||||||
| |||||||||
Vitamin K-beroende karboxylering/gamma-karboxiglutamin ( GLA ) domän är en proteindomän som innehåller post-translationella modifieringar av många glutamatrester genom vitamin K -beroende karboxylering för att bilda y-karboxyglutamat (Gla). Proteiner med denna domän kallas informellt Gla-proteiner . Gla-resterna är ansvariga för bindningen av kalciumjoner med hög affinitet.
GLA-domänen binder kalciumjoner genom att kelera dem mellan två karboxylsyrarester . Dessa rester är en del av en region som börjar vid den N-terminala änden av den mogna formen av Gla-proteiner, och som slutar med en konserverad aromatisk rest. Detta resulterar i ett konserverat Gla-x(3)-Gla-x-Cys-motiv som finns i mitten av domänen, och som verkar vara viktigt för substratigenkänning av karboxylaset.
3D-strukturerna för flera Gla-domäner har lösts. Kalciumjoner inducerar konformationsförändringar i Gla-domänen och är nödvändiga för att Gla-domänen ska vika sig ordentligt. Ett vanligt strukturellt drag hos funktionella Gla-domäner är klustringen av N-terminala hydrofoba rester till en hydrofob lapp som förmedlar interaktion med cellytmembranet.
För närvarande har följande humana Gla-innehållande proteiner (Gla-proteiner) karakteriserats till nivån av primär struktur: blodkoagulationsfaktorerna II (protrombin), VII, IX och X, de antikoagulerande proteinerna C och S, och faktorn X-riktat protein Z. Benet Gla-proteinet osteocalcin , det förkalkningshämmande matrisen Gla-proteinet (MGP), det celltillväxtreglerande "tillväxtstoppspecifika gen 6"-proteinet GAS6 , periostin (en faktor som är nödvändig för migration och vidhäftning av epitelceller), plus två prolinrika Gla-proteiner (PRGPs) och två transmembrana Gla-proteiner (TMGPs), vars funktioner är okända.
I alla fall där deras funktion var känd visade sig närvaron av Gla-rester i dessa proteiner vara avgörande för funktionell aktivitet.
Underfamiljer
- Koagulationsfaktor , Gla region InterPro : IPR002383
Humana proteiner som innehåller denna domän
- Trombin (F2) (aka koagulationsfaktor II; även dess prekursor protrombin) – involverat i koagulation
- Faktor VII (F7) – involverad i koagulation
- Faktor IX (F9) – involverad i koagulation
- Faktor X (F10) – involverad i koagulation
- Protein C (PROC) – roller för att reglera antikoagulering , inflammation , celldöd och upprätthålla permeabiliteten av blodkärlsväggar
- Protein S (PROS1) – involverat i koagulation
- Protein Z (PROZ) – involverat i koagulation
- Osteocalcin (BGLAP) – involverat i benmineralisering .
- Matrix gla protein (MGP) – hämmare av förkalkning av mjukvävnad och spelar en roll i benorganisation
- GAS6 – tros vara involverad i stimuleringen av cellproliferation
- Transthyretin (TTR) tidigare känt som prealbumin - transporterar tyroxin (T4) i blodet och in i ryggmärgsvätskan
- Inter-alfa-trypsinhämmare tung kedja H2 ( ITIH2 ) – spelar en roll i pankreas öar och många andra celler
- Periostin - en faktor som är nödvändig för cellmigration ( embryonal utveckling och immunsvar ) och vidhäftning av epitelceller , överuttryckt i vissa cancerformer
- Prolinrikt glaprotein 1 ( PRRG1 eller PRGP1)
- Prolinrikt glaprotein 2 ( PRRG2 eller PRGP2)
- Transmembrant y-karboxiglutamylprotein 3 ( PRRG3 eller TMG3, PRGP3)
- Transmembrant y-karboxiglutamylprotein 4 ( PRRG4 eller TMG4, PRGP4)