Genome@home
Genome@home var ett volontärprojekt som drivs av Stefan Larson från Stanford University och ett systerprojekt till Folding@home . Dess mål var proteindesign och dess tillämpningar, vilket hade implikationer inom många områden inklusive medicin . Genome@home drevs av Pande Lab.
Fungera
Efter Human Genome Project behövde forskare veta de biologiska och medicinska konsekvenserna av den resulterande mängden genetisk information. Genome@home använde extra processorkraft på persondatorer för att praktiskt taget designa gener som matchar befintliga proteiner , även om det också kan designa nya proteiner som inte har hittats i naturen. Denna process är beräkningskrävande, så distribuerad datoranvändning är ett gångbart alternativ. Forskare kan använda resultaten från projektet för att få en bättre förståelse för utvecklingen av naturliga genom och proteiner, och deras funktionalitet. Detta projekt hade tillämpningar inom medicinsk terapi , nya läkemedel och tilldelning av funktioner till nysekvenserade gener.
Genome@home studerade genom och proteiner direkt genom att praktiskt taget designa nya sekvenser för befintliga 3D-proteinstrukturer, som andra forskare erhöll genom röntgenkristallografi eller NMR -tekniker. Genom att förstå förhållandet mellan sekvenserna och specifika proteinstrukturer tog Pande-labbet upp samtida frågor inom strukturbiologi , genetik och medicin .
Specifikt hjälpte Genome@home-projektet förståelsen av varför tusentals olika aminosyrasekvenser alla bildar samma strukturer och hjälpte områdena proteomik och strukturgenomik genom att förutsäga funktionerna hos nyupptäckta gener och proteiner. Det hade också implikationer i medicinsk terapi genom att designa och praktiskt taget skapa nya versioner av befintliga proteiner. Genome@homes mjukvara är designad för enprocessorsystem . Det börjar med en stor uppsättning potentiella sekvenser, och upprepade gånger söker igenom och förfinar dessa sekvenser tills en väldesignad sekvens hittas. Den skickar sedan denna sekvens till servern och upprepar processen.
Slutsats
Av ekonomiska skäl avslutades projektet officiellt den 8 mars 2004, även om data fortfarande samlades in till den 15 april. Efter att det slutförts ombads användarna att donera till Folding@home istället.
Resultat
Den samlade en stor databas med proteinsekvenser, som kommer att användas för viktiga vetenskapliga ändamål i flera år av Pande Lab och andra forskare över hela världen.
Fyra peer-reviewed vetenskapliga publikationer har resulterat från Genome@home.