GIMIAS
 | |
 GIMIAS GUI inkluderar multislice-vy av multimodala biomedicinska bilder och signalnavigeringsverktyg
| |
| Stabil frisättning | 1.5.r4 / Oktober 2012
|
|---|---|
| Skrivet i | C++ |
| Operativ system | Windows , Linux |
| Typ | Vetenskaplig visualisering och bildberäkning |
| Licens | BSD-stil |
| Hemsida | |
GIMIAS är en arbetsflödesorienterad miljö fokuserad på biomedicinsk bildberäkning och simulering . Ramverket med öppen källkod kan utökas genom plugin-program och är fokuserat på att bygga forsknings- och kliniska prototyper av programvara . Gimias har använts för att utveckla kliniska prototyper inom områdena hjärtavbildning och -simulering, angiografiavbildning och -simulering samt neurologi
GIMIAS finansieras av flera nationella och internationella projekt som cvREMOD, euHeart eller VPH NoE.
Om GIMIAS
GIMIAS står för Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation. GIMIAS tillhandahåller ett grafiskt användargränssnitt med alla huvuddata-IO, visualiserings- och interaktionsfunktioner för bilder, maskor och signaler. GIMIAS funktioner inkluderar:
- DICOM -webbläsare och PACS -anslutning
- Stöd för olika bildbehandlingsmodaliteter
- Biomedicinsk datavisualisering i 2D och 3D: flerplansreformering, ortosnittvy, multisegmentvy, volymrendering, röntgenrendering , maximal intensitetsprojektion
- Flera in- och utdataformat: DICOM , vtk, stl, Nifty, Analyze.
- Filmkontroll: spela upp, pausa, hastighetskontroll
- Flera dataobjekt: 2D DICOM-bilder, 3D-bilder, ytmaskor, volymetriska maskor, signaler eller anteckningar
- Bild- och ytmaskannoteringar: landmärken, mått och intressanta områden
- Klinisk arbetsflödesnavigering som kan hjälpa användaren att navigera från patientdata till användbar information för patientbehandling.
- Andra ytterligare verktyg för bildsegmentering , mesh-manipulation och signalnavigering.
GIMIAS är ett utvecklingsramverk som låter utvecklare skapa sina egna medicinska applikationer med hjälp av olika plug-ins som kan laddas dynamiskt och kombineras. Prototyperna som utvecklats på GIMIAS kan verifieras av slutanvändare i verkliga scenarier och med riktiga data i tidiga utvecklingsstadier.
Utvecklas med C++- språk, har en plug-in- arkitektur och är plattformsoberoende med hjälp av standardverktyget CMake . Är möjligt att integrera nya bibliotek med hjälp av CSnake-verktyget och är baserat på vanliga bibliotek med öppen källkod som VTK , ITK , MITK, BOOST och wxWidgets . En plugin kan utöka ramverket och lägga till nya bearbetningskomponenter, GUI-komponenter som verktygsfält eller fönster, nya databehandlingstyper eller nya renderingsbibliotek.
GIMIAS stöder flera typer av plugin-program, från en enkel DLL, en 3D Slicer -kompatibel kommandoradsplugin eller en mer komplex GIMIAS-plugin med anpassat grafiskt gränssnitt. Automatiserad GUI-generering och utökningsbar dataobjektmodell gör det möjligt att dela plugin-program med andra ramverk och möjliggör interoperabilitet.
Programvaran är tillgänglig på Windows och Linux , 64-bitars och 32-bitars .
Historia
De första versionerna av ramverket med öppen källkod släpptes i slutet av 2009 (GIMIAS 0.6.15 släpptes i oktober 2009).
Under 2010 gjordes mer ansträngningar för att förstärka själva ramverket med öppen källkod, vilket ger mer funktionalitet som arbetsflödeshanterare, kompatibilitet med plugin-program för 3D Slicer , signalvisare och anpassningsbara vyer. GIMIAS version 0.8.1, 1.0.0, 1.1.0 och 1.2.0 släpptes under detta år.
GIMIAS Team har samarbetat med:
- cmgui-teamet: att testa användningen av det interimistiska cmgui API från GIMIAS mjukvaruplattform
- CTK-gruppen
- B3C-grupp (MAF)
GIMIAS är ett av verktygen som används i Virtual Physiological Human .
Kliniska prototyper
- AngioLab är ett mjukvaruverktyg utvecklat inom GIMIAS ramverk och är en del av en mer ambitiös pipeline för integrerad hantering av cerebrala aneurysm. AngioLab inkluderar för närvarande fyra plug-ins: angiosegmentering, angiomorfologi virtuell stentning och virtuell angiografi. I december 2009 fyllde 23 läkare i ett utvärderingsformulär om AngioLab. Denna aktivitet var en del av en undervisningskurs som hölls under den 2:a European Society for Minimally Invasive Neurovascular Treatment (ESMINT) undervisningskurs som hölls vid Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spanien. Den automatiska morfologiska analysen (angiomorfologisk plug-in) och endovaskulär behandlingsplanering (stenting plug-in) utvärderades. Generellt sett ansågs resultaten från dessa verktyg som relevanta och som ett framväxande behov inom deras kliniska område.
- CardioLab : CardioLab-sviten för GIMIAS gör det möjligt att utföra ett helt arbetsflöde från medicinska bilder till karakterisering och kvantifiering av hjärtsjukdomar och planering av hjärtresynkroniseringsterapi (CRT) .
- FocusDET : Noggrann lokalisering av epileptogena foci i svårbehandlad partiell epilepsi är väsentlig för att bedöma möjligheten till operation som behandling. Ett specifikt mjukvarupaket utvecklades för att lokalisera det epileptogena fokuset med hjälp av Ictal och Inter-ictal SPECT-bilder och MRI med hjälp av SISCOM-metoden. FocusDET utvecklades med hjälp av GIMIAS-faciliteter.
- QuantiDopa är en programvara som gör det möjligt att utföra en halvautomatisk kvantifiering av det striatala upptaget i neurotransmission SPECT-studier av det dopaminerga systemet.
