FAKTA (biologi)

FAKTA ( underlättar kromatin - transkription , ibland underlättar kromatin - transaktioner ) är ett heterodimert proteinkomplex som påverkar eukaryot RNA -polymeras II (Pol II) transkriptionsförlängning både in vitro och in vivo . Det upptäcktes 1998 som en faktor renad från mänskliga celler som var avgörande för produktiv, in vitro Pol II-transkription på en kromatiniserad DNA-mall.

FACT består av 140 och 80 kilodalton (kDa) subenheter. 140 kDa-subenheten kodas av den humana genen SUPT16H (36 % identisk med S. cerevisiae -genen Spt16) medan 80 kDa-subenheten kodas av den humana genen SSRP1 (POB3 i S. cerevisiae ). Båda dessa subenheter i jäst påverkar Pol II-transkriptionsförlängningen, och renat humant FACT binder specifikt till mononukleosomer och histonen H2A / H2B -dimeren, men inte till H3 / H4 -tetrameren (se: Nukleosomkärnpartikel ) eller Pol II.

Samimmunoprecipitationsanalyser med taggade rekombinanta proteiner visade att Spt16-subenheten interagerar med H2A/H2B-dimerer och mononukleosomer, men inte H3/H4-tetramerer, medan SSRP1-subenheten endast interagerar med H3/H4-tetramerer och inte mononukleosomer. Borttagning av den mycket sura C-terminalen av Spt16 (ett vanligt kännetecken för kända histonchaperoner) hindrar inte Spt16 från att bilda ett stabilt komplex med SSRP1, men det eliminerar interaktion med mononukleosomer och förmåga att stimulera in vitro-transkription på kromatiniserade mallar. De två underenheterna tillsammans, men ingen av dem ensamma, kan stimulera bildningen av nukleosomer från fria histoner och DNA (histonchaperonaktivitet ) . Dessa två subenheter är mycket konserverade över alla eukaryoter och har förutom transkription även visat sig påverka DNA-reparation och replikation.

I celler anrikas FACT på delar av genomet som är involverat i aktivt förlängning av Pol II, vilket kan ses i fluorescerande antikroppsfärgning av Drosophila polytene-kromosomer och kromatinimmunoutfällningsanalyser (ChIP) på Drosophila Kc-cellextrakt.

Vidare läsning

Reinberg, D., Sims, R. (2006). de FACTo nukleosomdynamik . Journal of Biological Chemistry, 281 (33) 23297-23391.