SUPT16H

SUPT16H
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CDC68, FACTP140, SPT16/CDC68, SPT16, SPT16 homolog, underlättar kromatinremodelleringsunderenhet, NEDDFAC
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

FACT-komplexsubenheten SPT16 är ett protein som hos människor kodas av SUPT16H -genen .

Fungera

Transkription av proteinkodande gener kan rekonstitueras på naket DNA med endast de allmänna transkriptionsfaktorerna och RNA-polymeras II . Detta minimala system kan dock inte transkribera DNA förpackat till kromatin , vilket indikerar att accessoriska faktorer kan underlätta tillgången till DNA. En sådan faktor, FACT (underlättar kromatintranskription), interagerar specifikt med histoner H2A / H2B för att åstadkomma nukleosomdemontering och transkriptionsförlängning. FACT består av en 80 kDa subenhet och en 140 kDa subenhet, varav den senare är proteinet som kodas av denna gen.

Interaktioner

SUPT16H har visats interagera med BAZ1B .

Vidare läsning

•   LeRoy G, Orphanides G, Lane WS, Reinberg D (1998). "Krav på RSF och FACT för transkription av kromatinmallar in vitro". Vetenskap . 282 (5395): 1900–4. doi : 10.1126/science.282.5395.1900 . PMID 9836642 .
•    Orphanides G, Wu WH, Lane WS, Hampsey M, Reinberg D (1999). "Den kromatinspecifika transkriptionsförlängningsfaktorn FACT omfattar humana SPT16- och SSRP1-proteiner". Naturen . 400 (6741): 284–8. Bibcode : 1999Natur.400..284O . doi : 10.1038/22350 . PMID 10421373 . S2CID 4300397 .
•   Kang SW, Kuzuhara T, Horikoshi M (2000). "Funktionell interaktion av allmän transkriptionsinitieringsfaktor TFIIE med allmän kromatinfaktor SPT16/CDC68" . Gener Celler . 5 (4): 251–63. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00323.x . PMID 10792464 .
•   Wada T, Orphanides G, Hasegawa J, Kim DK, Shima D, Yamaguchi Y, Fukuda A, Hisatake K, Oh S, Reinberg D, Handa H (2000). "FAKTA lindrar DSIF/NELF-medierad hämning av transkriptionell förlängning och avslöjar funktionella skillnader mellan P-TEFb och TFIIH" . Mol. Cell . 5 (6): 1067–72. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80272-5 . PMID 10912001 .
•   Keller DM, Lu H (2003). "p53 serin 392-fosforylering ökar efter UV genom induktion av sammansättningen av CK2.hSPT16.SSRP1-komplexet" . J. Biol. Chem . 277 (51): 50206–13. doi : 10.1074/jbc.M209820200 . PMID 12393879 .
•   Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (2003). "Kromatinombyggnadskomplexet WINAC riktar sig mot en nukleär receptor till promotorer och är nedsatt vid Williams syndrom. " Cell . 113 (7): 905–17. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 . PMID 12837248 .
•    Belotserkovskaya R, Oh S, Bondarenko VA, Orphanides G, Studitsky VM, Reinberg D (2003). "FAKTA underlättar transkriptionsberoende nukleosomförändring". Vetenskap . 301 (5636): 1090–3. Bibcode : 2003Sci...301.1090B . doi : 10.1126/science.1085703 . PMID 12934006 . S2CID 26667338 .
•    Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). "Reglering av alternativ splitsning av SRrp86 och dess interagerande proteiner" . Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
•   Tan BC, Lee SC (2004). "Nek9, ett nytt FACT-associerat protein, modulerar interfasprogression" . J. Biol. Chem . 279 (10): 9321–30. doi : 10.1074/jbc.M311477200 . PMID 14660563 .
•   Fryer CJ, White JB, Jones KA (2005). "Mastermind rekryterar CycC:CDK8 för att fosforylera Notch ICD och koordinera aktivering med omsättning" . Mol. Cell . 16 (4): 509–20. doi : 10.1016/j.molcel.2004.10.014 . PMID 15546612 .
•    Kouskouti A, Talianidis I (2005). "Histonmodifieringar som definierar aktiva gener kvarstår efter transkriptionell och mitotisk inaktivering" . EMBO J . 24 (2): 347–57. doi : 10.1038/sj.emboj.7600516 . PMC 545808 . PMID 15616580 .
•    Huang JY, Chen WH, Chang YL, Wang HT, Chuang WT, Lee SC (2006). "Modulation av nukleosombindande aktivitet av FACT genom poly(ADP-ribosyl)ation" . Nucleic Acids Res . 34 (8): 2398–407. doi : 10.1093/nar/gkl241 . PMC 1458519 . PMID 16682447 .
•   Pavri R, Zhu B, Li G, Trojer P, Mandal S, Shilatifard A, Reinberg D (2006). "Histone H2B monoubiquitination fungerar i samarbete med FACT för att reglera förlängning av RNA-polymeras II" . Cell . 125 (4): 703–17. doi : 10.1016/j.cell.2006.04.029 . PMID 16713563 .
•    Tan BC, Chien CT, Hirose S, Lee SC (2006). "Funktionellt samarbete mellan FACT och MCM-helikas underlättar initiering av kromatin-DNA-replikation" . EMBO J . 25 (17): 3975–85. doi : 10.1038/sj.emboj.7601271 . PMC 1560368 . PMID 16902406 .
•    Biswas D, Dutta-Biswas R, Mitra D, Shibata Y, Strahl BD, Formosa T, Stillman DJ (2006). "Motstående roller för Set2 och yFACT vid reglering av TBP-bindning vid promotorer" . EMBO J . 25 (19): 4479–89. doi : 10.1038/sj.emboj.7601333 . PMC 1589996 . PMID 16977311 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q9Y5B9 (FAKTA komplex subenhet SPT16) på PDBe-KB .