Fågelmetaavulavirus 2
| Avian metaavulavirus 2 | |
|---|---|
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Negarnaviricota |
| Klass: | Monjiviricetes |
| Beställa: | Mononegavirales |
| Familj: | Paramyxoviridae |
| Släkte: | Metaavulavirus |
| Arter: |
Fågelmetaavulavirus 2
|
| Synonymer | |
|
|
Aviärt metaavulavirus 2 , tidigare aviärt paramyxovirus 2 , är en virusart som tillhör familjen Paramyxoviridae och släktet Metaavulavirus . Viruset är ett negativt RNA-virus som innehåller ett monopartit genom. Fågelmetaavulavirus 2 är en av nio arter som tillhör släktet Metaavulavirus . Den vanligaste serotypen av Avulavirinae är serotyp 1, orsaken till Newcastlesjukan (ND). Aviärt luftvägsinfektioner , metaavulavirus 2 har varit känt för att orsaka sjukdom, särskilt milda hos tamfjäderfä , inklusive kalkoner och höns och har många ekonomiska effekter på äggproduktion och fjäderfäindustrier . Viruset isolerades först från en stam i Yucaipa, Kalifornien 1956. Sedan dess har andra isolat av viruset isolerats över hela världen.
Viral klassificering
Aviärt metaavulavirus 2 är ett negativt sens RNA-virus med ett monopartit genom . Det tillhör grupp V i Baltimores klassificeringssystem av virus.
Strukturera
Alla paramyxovirusviruspartiklar är sammansatta av en ribonukleoproteinkärna och ett lipoproteindubbelskikt. Aviärt paramyxovirus innehåller ett viralt hölje som kapslar in en sfärisk viral kapsid som innehåller negativ-sens RNA-genomet. Medlemmarna av Paramyxoviridae , inklusive fågelmetaavulavirus 2 , följer "sexregeln", med en genomlängd som är en multipel av sex. Detta möjliggör korrekt packning av genomet i nukleokapsiden . Strukturen av höljet kännetecknas av de spikliknande projektionerna av två virala proteiner, fusionsproteinet (F) och hemagglutinin-neuraminidas (Hn) protein. Dessa proteinprojektioner kan emellertid skilja sig mellan de nio serotyperna av fågelparamyxovirus. Matrisproteinet (M) tros bilda det inre lagret av höljet och interagerar med F- och Hn-proteinerna på utsidan av det virala höljet under viralt inträde.
Genom
Fågelmetaavulavirus 2 har ett negativt-sens RNA-genom som vid inträde i cellen måste transkriberas till ett positiv-sens- mRNA för att producera virala proteiner och för att replikera genomet. Det har antagits genom elektronmikroskopi att genomet antar en vänsterhänt spiralstruktur. Genomstorleken för en isolerad Yucaipa-stam, isolerad från kycklingar i Yucaipa, Kalifornien 1956, är 14 904 nukleotider lång och innehåller en ledarsekvens på 55 nukleotider i 3'-änden och en trailersekvens på 154 nt vid 5'-änden. Emellertid har andra isolerade stammar av Avian metaavulavirus 2 isolerats som innehåller genom av liknande, men olika, längder. Aviärt metaavulavirus 2 är ett av de minsta i familjen Paramyxoviridae . Genomet kodar för sex virala proteiner som är separerade från varandra via intergena regioner som är mellan 3-23 nukleotider långa. De sex virala generna är omgivna av regioner för transkriptionsstopp och startsignaler som hjälper till med transkription av genomet och produktion av subgenomiska RNA. De virala genomen av de flesta paramyxovirusserotyper kodar gener för ett nukleokapsidprotein (N), ett fosfoprotein (P), ett matrisprotein (M), ett fusionsprotein (F), ett hemagglutinin-neuraminidas (Hn) protein och ett stort polymerasprotein (L).
Replikeringscykel
Bilaga och inträde
Ett gemensamt kännetecken för alla paramyxovirus är närvaron av två membranförankrade glykoproteiner , ett som krävs för virionfästning och ett som krävs för fusion. Det antas att F- och Hn-proteinerna som finns på virusets yttre hölje hjälper till att ta sig in av viruset i värdcellen. Fusionsproteinet (F) är ett integrerat membranprotein som delar många egenskaper som liknar andra virala fusionsproteiner och är direkt involverat i virusfusion. Man tror att två heptadupprepningsregioner (HR1) och (HR2) bildar en buntstruktur med sex helix som hjälper till att inducera fusion av det virala membranet med värdcellmembranet. Hn-proteinet består av en stjälk och ett globulärt huvud som innehåller receptorbindande egenskaper som binder till sialinsyrareceptorer som finns på celler i värdens övre luftvägar. Det antas att interaktioner mellan Hn- och F-proteinerna orsakar konformationsförändringar i de respektive proteinerna som kontrollerar vidhäftningen och fusionen av den virala kapsiden med värdcellmembranet.
Viral replikation och produktion av viralt protein
Paramyxovirus kodar bara för ett RNA-polymeras och man tror att replikering sker i cellens cytoplasma, utan inblandning eller inträde i värdcellskärnan. Lite är förstått om hur polymeraset hjälper till vid både viral replikation och transkription och hur dessa processer kan regleras. Det kodade polymeraset består av två proteiner, en stor subenhet som ansvarar för RNA-syntes och kapsling, och det kodade proteinet fosfoprotein (P) som fungerar som en kofaktor. Som beskrivits inkluderar det virala genomet intergena regioner mellan de virala generna med specifika start- och stoppsignaler. Polymeraset känner igen dessa cis-verkande element i det virala genomet och initierar transkription. Transkription börjar först vid 3'-änden av genomet vid en 40-55 nukleotider lång promotorregion . Polymeraset producerar subgenomiska RNA genom att transkribera varje gen, frigöra det producerade RNA:t och sedan lokalisera nästa gen för transkription av de cis-verkande elementen som finns i genomet. Signalen vid vilken polymeraset frisätter det transkriberade RNA:t från en enda gen antas innehålla en poly-U-kanal , vilket leder till att en poly(A)-svans täcks av det transkriberade RNA:t. I motsats till att producera viralt mRNA för viral proteinsyntes, vid replikering av det virala genomet, startar och stannar inte polymeraset vid de indikerade cis-verkande elementen mellan varje gen. Istället förlänger polymeraset RNA:t längs genomets hela längd. Beskriven ovan är en modell för hypotesen viral replikation och proteinproduktion av paramyxovirus, men det finns andra modeller som tyder på att polymeraset initierar replikation och transkription vid olika områden i genomet.
Montering och frigöring
Man tror att matrisproteinet (M) på insidan av det virala höljet spelar en viktig roll vid knoppning av virusliknande partiklar från den infekterade värdcellen. M-proteinet interagerar med Hn- och F-proteinerna, vilket hjälper till att införliva dessa proteiner i viruspartiklar för frisättning. Det har antagits att matrisproteiner av paramyxovirus interagerar med det vakuolära sorteringssystemet för värdproteiner för att initiera knoppning av värdcellmembranet. Interaktionerna mellan Hn-, F- och M-proteinerna är inte väl förstådda, men man tror att paramyxovirussammansättning och frisättning är beroende av protein-proteininteraktioner och specifik inriktning av proteiner till områden av värdcellen och membranet
Interaktioner med värden
I cellodling uttrycker många paramyxovirus en cytopatisk effekt genom syncytiumbildning , fusion av infekterade celler med närliggande celler som producerar en stor cell med flera kärnor. Vissa serotyper av fågelparamyxovirus visar dock inte syncytiumbildning, endast cellavrundning. Studier har visat att vid infektion bildas mikroskopiska lesioner i luftstrupen, lungorna och, mer sällan, i tarmen hos djurmodeller infekterade med aviärt metaavulavirus 2 . Det har också visats att modellfåglar infekterade med isolat av aviärt metaavulavirus 2 upplever diarré och visar förstorad bukspottkörtel.
Tropism
Aviärt metaavulavirus 2 tros infektera vävnader i luftvägarna och i vissa fall vävnader i lungorna. Det virala höljesproteinet, Hn, binder till sialinsyrarester som finns i celler i de övre luftvägarna. Det har visat sig att hos kycklingar kan vissa uppvisa milda andningssymtom eller vara asymtomatiska. Man tror att mer allvarliga symtom inklusive bihåleinflammation och en minskning av äggproduktionen förekommer hos kalkoner. Andra symtom inklusive minskad kläckbarhet och infertilitet hos ägg har rapporterats.
Virusdistribution
Aviärt metaavulavirus 2 har reservoarer i vilda fågelarter och är känt för att orsaka luftvägssjukdomar och ha ekonomiska effekter på äggproduktion och fjäderfäindustri . Men andra värdar inkluderar kycklingar, skenor och psittaciner . Aviärt metaavulavirus 2 har rapporterats hos fåglar i Europa, Asien och Nord- och Sydamerika. I USA har det visat sig att viruset mer sannolikt infekterar kalkoner än kycklingar. Isolat av aviärt metaavulavirus 2 har återvunnits från områden i USA, Bulgarien, Costa Rica, Afrika och många andra platser, vilket tyder på att aviärt metaavulavirus 2 förekommer över hela världen.
Transmission och kontroll
Överföring sker långsamt mellan domesticerade kalkonflockar i USA och överföringssättet är inte väl definierat. Det antas att infektioner av aviärt metaavulavirus 2 hos tama fjäderfä härrör från interaktioner med infekterade vilda fåglar. Förebyggande åtgärder kan vidtas för att förhindra spridning av aviärt metaavulavirus 2 i tama flockar. Sådana förebyggande åtgärder inkluderar att minimera interaktioner mellan flockar och vilda fåglar genom att fågelskydda områden där fjäderfän hålls och föds upp och goda hygienrutiner. Inga mänskliga infektioner har rapporterats av aviärt metaavulavirus 2
- ^ Balkema-Buschmann, Anne; et al. (6 juni 2018). "Omorganisation av familjen Paramyxoviridae " . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Hämtad 3 maj 2019 .
-
^
Rima, Bertus K.; et al. (juni 2016). "Lägga till en (1) ny art och namngivning av tolv (12) arter i släktet Avulavirus " (PDF) . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Hämtad 3 maj 2019 .
För att byta namn på följande taxon (eller taxa): Artnamnen i släktet Avulavirus . Aktuellt namn Föreslaget namn Avian paramyxovirus 2 Avian avulavirus 2
- ^ ICTV 3:e rapport Matthews, REF (1979). Klassificering och nomenklatur av virus. Tredje rapporten från Internationella kommittén för taxonomi av virus. Intervirology 12: 129-296. s217 https://ictv.global/ictv/proposals/ICTV%203rd%20Report.pdf
- ^ 1ICTV 5:e rapport Francki, RIB, Fauquet, CM, Knudson, DL & Brown, F. (eds) (1991). Klassificering och nomenklatur av virus. Femte rapporten från International Committee on Taxonomy of Viruses. Archives of Virology Supplementum 2, p244 https://ictv.global/ictv/proposals/ICTV%205th%20Report.pdf
- ^ a b c d e Warke, Ashwini; Stallknecht, David; Williams, Susan M.; Pritchard, Nikki; Mundt, Egbert (2008). "Jämförande studie om patogeniciteten och immunogeniciteten hos vilda fågelisolat av fågelparamyxovirus 2, 4 och 6 hos kycklingar". Fågelpatologi . 37 (4): 429–434. doi : 10.1080/03079450802216645 . PMID 18622861 . S2CID 3995370 .
- ^ a b c d e f "Andra fågelparamyxovirusinfektioner - fjäderfä - Merck veterinärhandbok" . Merck veterinärhandbok . Hämtad 2017-11-02 .
- ^ a b c Anderson, Danielle (2011). Paramyxovirusens biologi . ISBN 9781904455851 .
- ^ a b c d e f g Kim, Shin-Hee (2012). "Replikation, neurotropism och patogenicitet av aviärt paramyxovirus serotyper 1-9 hos kycklingar och ankor" . PLOS ETT . 7 (4): e34927. Bibcode : 2012PLoSO...734927K . doi : 10.1371/journal.pone.0034927 . PMC 3340391 . PMID 22558104 .
- ^ a b c d Zarkov, Iv (2015). "Översikt av infektion med aviärt paramyxovirus serotyp 2 (APMV-2) och de första resultaten av Bulgarien" ( PDF) .
- ^ a b c Subbiah, Madhuri; Xiao, Sa; Collins, Peter L.; Samal, Siba K. (2008-10-01). "Fullständig sekvens av genomet av fågelparamyxovirus typ 2 (stam Yucaipa) och jämförelse med andra paramyxovirus" . Virusforskning . 137 (1): 40–48. doi : 10.1016/j.virusres.2008.05.012 . PMC 2700353 . PMID 18603323 .
- ^ a b c "Paramyxovirus-inträde (PDF-nedladdning tillgänglig)" . ResearchGate . Hämtad 2017-11-02 .
- ^ Wang, Xiao-Jia; Bai, Ya-Duo; Zhang, Guo-Zhong; Zhao, Ji-Xun; Wang, Ming; Gao, George F. (april 2005). "Struktur- och funktionsstudie av paramyxovirusfusionsproteinheptadupprepningspeptider" . Arkiv för biokemi och biofysik . 436 (2): 316–322. doi : 10.1016/j.abb.2005.02.004 . PMC 7094221 . PMID 15797244 .
- ^ a b c d e f Noton, Sarah L.; Fearns, Rachel (2015-05-01). "Initiering och reglering av paramyxovirustranskription och replikation" . Virologi . 60-årsjubileumsnummer. 479–480 (tillägg C): 545–554. doi : 10.1016/j.virol.2015.01.014 . PMC 4424093 . PMID 25683441 .
- ^ a b Pantua, Homer D.; McGinnes, Lori W.; Peeples, Mark E.; Morrison, Trudy G. (2006-11-01). "Krav för montering och frisättning av virusliknande partiklar från Newcastlesjukan" . Journal of Virology . 80 (22): 11062–11073. doi : 10.1128/JVI.00726-06 . ISSN 0022-538X . PMC 1642154 . PMID 16971425 .
- ^ Alexander, DJ (2000). "Newcastlesjukan och andra fågelparamyxovirus" (PDF) . Revue Scientifique et Technique (International Office of Epizootics) . 19 (2): 443–62. PMID 10935273 .