DUX4
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DUX4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , DUX4L, dubbel homeobox 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dubbel homeobox, 4 även känd som DUX4 är ett protein som hos människor kodas av DUX4 -genen . Dess feluttryck är orsaken till facioscapulohumeral muskeldystrofi (FSHD).
Gen
| CEN | centromerisk ände | TEL | telomerisk ände |
| NDE-låda | icke-raderade element | PAS | polyadenyleringsställe _ |
| triangel | D4Z4 upprepning | trapets | partiell D4Z4-upprepning |
| vit låda | pLAM | gråa lådor | DUX4 exon 1, 2, 3 |
| pilar | |||
| hörn | promotorer | hetero | RNA-transkript |
| svart | känsla | röd | antisense |
| blå | DBE-T | streck | tärningsplatser |
Denna gen är belägen inom en D4Z4- makrosatellitupprepningsarray i den subtelomera regionen av kromosom 4q35 . D4Z4-upprepningsarrayen innehåller 11-150 D4Z4-upprepningar i den allmänna populationen; en mycket homolog D4Z4-upprepningsarray har identifierats på kromosom 10. Genen består av tre exoner . Exon 1 och 2 finns i varje D4Z4-upprepning. Endast en kopia av exon 3 är närvarande, telomerisk till D4Z4-upprepningsarrayen. Den öppna läsramen (ORF) är helt innesluten i exon 1 och innehåller två homeoboxar . Exon 2 och 3 kodar för de tre primära otranslaterade regionen (3'-UTR). I vissa haplotyper innehåller exon 3 en polyadenyleringssignal . Det fanns inga bevis för transkription från standard- cDNA-bibliotek, men RT-PCR och in vitro-expressionsexperiment indikerar att ORF är transkriberat.
Upprepningsarrayen och ORF är bevarade i andra däggdjur.
Strukturera
DUX4-protein är 424 aminosyror långt. Två homeodomäner är belägna vid N-terminalen . En transkriptionsaktiverande domän (TAD) och p300 -bindande domän är belägna vid C-terminalen . TAD omfattar en potentiell nio aminosyror TAD (9aaTAD).
De två homeodomänerna och TAD har väldefinierad tertiär struktur. Regionen mellan den andra homeodomänen och TAD förutsägs vara störd.
DUX4 -transkript kan splittas för att producera antingen DUX4-S (kort) eller DUX4-FL (fullängd) mRNA. DUX4-FL mRNA kodar för hela DUX4-proteinet. DUX4-S mRNA kodar för ett partiellt DUX4-protein, som saknar den transkriptionsaktiverande domänen.
Fungera
DUX4-protein en transkriptionell aktivator av många gener, ett exempel är parad-liknande homeodomän transkriptionsfaktor 1 ( PITX1 ). Det stimulerar sannolikt aktivering av zygotisk genom . [ citat behövs ]
De två homeodomänerna tillåter DUX4-protein att binda till DNA. Den C-terminala domänen är involverad i målgenaktivering.
DUX uttrycks normalt i testiklarna , tymus och embryon i klyvningsstadiet .
Klinisk signifikans
Olämpligt uttryck av DUX4 i muskelceller är orsaken till facioscapulohumeral muskeldystrofi (FSHD).
Överuttryck av DUX4 på grund av translokationer kan orsaka B-cellsleukemi . En translokation som slår samman DUX4 med CIC kan orsaka en aggressiv typ av sarkom .
Se även
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .