CidA/LrgA holin

CidA /LrgA Holin (CidA/LrgA Holin) familjen ( TC# 1.E.14 ) är en grupp av proteiner uppkallade efter CidA ( TC# 1.E.14.1.2 ) och LrgA ( TC# 1.E.14.1) .1 ) av Staphylococcus aureus . CidA och LrgA är homologa holin- och anti-holinproteiner, var och en med 4 förmodade transmembransegment (TMS). Medlemmar av CidA/LrgA-holinfamiljen inkluderar också förmodade murina hydrolasexportörer från ett brett spektrum av grampositiva och gramnegativa bakterier samt archaea . De flesta CidA/LrgA-holinfamiljens proteiner varierar i storlek mellan 100 och 160 aminoacylrester (aas) i längd även om några få är större.

Fungera

Det har föreslagits att CidA och CidB (23 % och 32 % identiska med LrgA respektive LrgB) är involverade i programmerad celldöd i en process som är analog med apoptos i eukaryoter. Dessa proteiner är kända för att reglera och påverka biofilmbildning genom att frisätta DNA från lyserade celler som bidrar till biofilmmatrisen. CidA, ett 131 aa-protein med 4 förmodade TMS, tros vara holinet som exporterar autolysinet CidB, medan LrgA kan vara ett anti-holin, ett protein som binder och hämmar holinaktivitet. Om detta är en allmän mekanism för programmerad celldöd, skulle detta förklara deras nästan allestädes närvarande i den prokaryota världen.

Uttryck

cidABC - operonet aktiveras av CidR i närvaro av ättiksyra. Både CidAB och LrgAB påverkar biofilmbildning, oxidativ stress, överlevnad i stationär fas och antibiotikatolerans på ett ömsesidigt sätt, och deras gener regleras av LytSR tvåkomponents regulatoriska system. Mikrofluidiska tekniker har använts för att följa genuttryck temporärt och spatialt under biofilmbildning , vilket avslöjar att både cidA och lrgA uttrycks mestadels i det inre av tornstrukturer i biofilmerna, reglerat av syretillgänglighet. Analoga proteiner kan kopplas till kompetens i S. mutanter .

Se även

• Holin
• Lysin
• Databas för klassificering av transportörer

Vidare läsning

•    Brunskill, EW; Bayles, KW (1996). "Identifiering av LytSR-reglerade gener från Staphylococcus aureus" . Journal of Bakteriologi . 178 (19): 5810–5812. doi : 10.1128/jb.178.19.5810-5812.1996 . PMC 178427 . PMID 8824633 .
•    Chen, Yun; Gozzi, Kevin; Yan, Fang; Chai, Yunrong (2015). "Ättiksyra fungerar som en flyktig signal för att stimulera bildning av bakteriell biofilm" . mBio . 6 (3): e00392. doi : 10.1128/mBio.00392-15 . PMC 4462622 . PMID 26060272 .
•   Desvaux, Mickaël; Khan, Arshad; Beatson, Scott A.; Scott-Tucker, Anthony; Henderson, Ian R. (2005). "Proteinsekretionssystem i Fusobacterium nucleatum: genomisk identifiering av typ 4-piliation och kompletta typ V-vägar ger ny insikt om mekanismer för patogenes" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembraner . 1713 (2): 92–112. doi : 10.1016/j.bbamem.2005.05.002 . PMID 15993836 .
•   Fischer, A.; Kambara, K.; Meyer, H.; Stenz, L.; Bonetti, E.-J.; Girard, M.; Lalk, M.; Francois, P.; Schrenzel, J. (2014). "GdpS bidrar till Staphylococcus aureus biofilmbildning genom reglering av eDNA-frisättning". International Journal of Medical Microbiology . 304 (3–4): 284–299. doi : 10.1016/j.ijmm.2013.10.010 . PMID 24275081 .
•    Patton, Toni G.; Rice, Kelly C.; Foster, Mary K.; Bayles, Kenneth W. (2005). "Staphylococcus aureus cidC-genen kodar för ett pyruvatoxidas som påverkar acetatmetabolism och celldöd i stationär fas". Molekylär mikrobiologi . 56 (6): 1664–1674. doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04653.x . PMID 15916614 . S2CID 34897582 .
•    Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015). "Holins i bakterier, eukaryoter och arkéer: multifunktionella xenologer med potentiella bioteknologiska och biomedicinska tillämpningar" . Journal of Bakteriologi . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•    Tran, Tram Anh T.; Struck, Douglas K.; Young, Ry (2005). "Periplasmatiska domäner definierar Holin-antiholin-interaktioner i T4-lysinhibering" . Journal of Bakteriologi . 187 (19): 6631–6640. doi : 10.1128/JB.187.19.6631-6640.2005 . PMC 1251592 . PMID 16166524 .

Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "1.E.14 The CidA/LrgA Holin (CidA/LrgA Holin) Family" , som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , men inte under GFDL . Alla relevanta villkor måste följas.