Betatorquevirus
| Betatorquevirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | incertae sedis |
| Rike: | incertae sedis |
| Provins: | incertae sedis |
| Klass: | incertae sedis |
| Beställa: | incertae sedis |
| Familj: | Anelloviridae |
| Släkte: | Betatorquevirus |
Betatorquevirus är ett släkte av virus i familjen Anelloviridae , i grupp II i Baltimore-klassificeringen . Släktet Betatorquevirus inkluderar alla "torque teno mini virus" (TTMV), numrerade från 1 till 38 som 38 arter.
Taxonomi
Släktet innehåller följande arter:
- Torque teno mini virus 1
- Torque teno mini virus 2
- Torque teno mini virus 3
- Torque teno mini virus 4
- Torque teno mini virus 5
- Torque teno mini virus 6
- Torque teno mini virus 7
- Torque teno mini virus 8
- Torque teno mini virus 9
- Torque teno mini virus 10
- Torque teno mini virus 11
- Torque teno mini virus 12
- Torque teno mini virus 13
- Torque teno mini virus 14
- Torque teno mini virus 15
- Torque teno mini virus 16
- Torque teno mini virus 17
- Torque teno mini virus 18
- Torque teno mini virus 19
- Torque teno mini virus 20
- Torque teno mini virus 21
- Torque teno mini virus 22
- Torque teno mini virus 23
- Torque teno mini virus 24
- Torque teno mini virus 25
- Torque teno mini virus 26
- Torque teno mini virus 27
- Torque teno mini virus 28
- Torque teno mini virus 29
- Torque teno mini virus 30
- Torque teno mini virus 31
- Torque teno mini virus 32
- Torque teno mini virus 33
- Torque teno mini virus 34
- Torque teno mini virus 35
- Torque teno mini virus 36
- Torque teno mini virus 37
- Torque teno mini virus 38
Inledande upptäckt
Upptäckten av TTMV, liksom det ursprungliga Torque Teno-virusisolatet (TTV), var oavsiktlig. Efter att TTV isolerades 1997 från en japansk patient skapades primers för att studera TTV mer i detalj. TTV-specifika primrar som användes i PCR av humana plasmaprover gav sekvenser som delvis matchade den för TTV, men var märkbart kortare. TTV uppfattades så småningom ha ett genom på 3,6–3,9 kb, medan TTMV har ett genom på 2,8–2,9 kb. Ett annat TT-liknande virus som senare isolerades 2007, Torque teno midi virus eller TTMDV, har ett genom på 3,2 kb.
Genom och kapsid
TTMV delar liknande morfologiska egenskaper med andra humana anellovirus. Kapsiden har en T=1 ikosaedrisk symmetri. Virionet har inget lipidhölje och är därför "naket", vilket gör det till ett extremt enkelt virus. Det uppskattas att virionet är lite mindre än 30 nm i diameter.
Genomet är cirkulärt och gjort av enkelsträngat DNA med negativ polaritet. Den är 2,86–2,91 kilobaser lång. Anellovirus är kända för att ha 3 eller 4 överlappande, kapslade öppna läsramar; TTMV har 3 ORF som överlappar varandra. ORF-2 och ORF-3 överlappar med ORF-1 vid motsatta ändar. För TTMV är ORF-1 cirka 663 rester och ORF-2 är cirka 91 rester lång. Det finns en mycket bevarad 130-nt-region precis nedströms om TATA-boxen.
Fylogeni & spridning
TTMV är mycket divergerande. Det första fylogenetiska trädet skapat från TTMV genomiska sekvenser avslöjade ett stort kluster av stammar; ORF-1 hade divergenser på över 42 % på nukleotidnivå och över 67 % på aminosyranivå.
TTMV är också mycket utbredd, liksom andra humana anellovirus. Efterföljande forskning efter att det upptäcktes har visat att prevalensen av TTMV-DNA bland blodgivare är 48–72 %. Det kan sannolikt infektera ett brett spektrum av vävnader, eftersom det har isolerats från olika kroppsvätskor och vävnader, inklusive saliv, avföring, plasma/serum, PBMC, benmärg, mjälte, bukspottkörtel, njurar, nervvävnad, lymfkörtlar, sperma , och cervikala pinnar. Dess exakta överföringsmekanism är okänd, men tros vara möjlig via blodburna, sexuella, fekal-orala och andningsvägar.
Nyligen genomförda studier har visat att människor kan ha flera infektioner av TT-virus.
Klinisk
Även om TTV är potentiellt associerade med dieaser och deras patogenicitet har diskuterats sedan upptäckten, är TTMV för närvarande inte känd som en explicit orsak till någon mänsklig sjukdom. TTMV har isolerats från ett antal parapneumoniska empyem . Dess kliniska betydelse är dock fortfarande oklar.
externa länkar
- ICTV Virus Taxonomy 2009
- UniProt taxonomi
- Anellovirus vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- ICTVdb
- ViralZone: Betatorquevirus