Argininrepressor ArgR
| Argininrepressor, C-terminal domän | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 c-terminal domän av escherichia coli argininrepressor/l-argininkomplex; pb-
| |||||||||
| derivatidentifierare | |||||||||
| Symbol | Arg_repressor_C | ||||||||
| Pfam | PF02863 | ||||||||
| InterPro | IPR020899 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Argininrepressor, DNA-bindande | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| domänidentifierare | |||||||||
| Symbol | Arg_repressor | ||||||||
| Pfam | PF01316 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologin är argininrepressorn ( ArgR ) en repressor av prokaryota arginindeiminasvägar.
Arginindihydrolas (AD)-vägen finns i många prokaryoter och vissa eukaryoter, ett exempel på den senare är Giardia lamblia ( Giardia intestinalis ) . Den anaeroba vägen med tre enzymer bryter ner L-arginin och bildar 1 mol ATP, koldioxid och ammoniak . Hos vissa bakterier kan det första enzymet, arginindeiminas , stå för upp till 10 % av det totala cellproteinet .
De flesta prokaryota arginindeiminasvägar är under kontroll av en repressorgen , benämnd ArgR. Detta är en negativ regulator och frigör endast arginindeiminasoperonet för uttryck i närvaro av arginin. Kristallstrukturen för apo-ArgR från Bacillus stearothermophilus har bestämts till 2,5A med hjälp av röntgenkristallografi . Proteinet existerar som en hexamer av identiska subenheter och har visat sig ha sex DNA-bindande domäner, klustrade runt en central oligomer kärna när det är bundet till arginin. interagerar huvudsakligen med AT- rester i ARG-lådor. Detta hexameriska protein binder DNA vid dess N-terminal för att undertrycka argininbiosyntes eller aktivera argininkatabolism . Vissa arter har flera ArgR- paraloger . I ett angränsande träd visar några av dessa paraloga sekvenser långa grenar och skiljer sig signifikant från den välkonserverade C-terminala regionen.