Alan Garfinkel

Alan Garfinkel är professor vid University of California, Los Angeles vid avdelningarna för medicin (kardiologi) och integrativ biologi och fysiologi. Hans forskningsarbete tillämpar icke-linjär dynamik på hjärtarytmier och på skapandet av biologiska mönster i rum och tid. Som lärare skapade han en ny kurs för att lära ut dynamik och modellering för biologistudenter, utan någon "kalkyl"-förutsättning.

tidigt liv och utbildning

Alan Garfinkel föddes i Brooklyn, New York. Efter att ha deltagit i offentliga skolor i New York City tog han examen från Cornell University 1966 med en examen i matematik och filosofi. Efter två år vid MIT flyttade han till Harvard University , där han tog en doktorsexamen i filosofi 1975.

Forskning och karriär

I Garfinkels doktorsavhandling, skriven under Hilary Putnam , som Yale University Press publicerade som Forms of Explanation, föreslog han begreppet Contrastive Explanation, som ett svar på frågan "Varför X?" är verkligen ett svar på "Varför X snarare än en begränsad uppsättning alternativ till det?".

Han blev hjärtforskare och modellerare, och han och hans team identifierade matematiskt (deterministiskt) kaos i en riktig kaninhjärtarytmi, och använde sedan "kaoskontroll"-tekniker för att stabilisera arytmin till periodisk misshandel. Med hjälp av analytiska tekniker från olinjär dynamik visade han och hans kollegor Zhilin Qu och James N Weiss sedan att ventrikelflimmer (VF), den primära orsaken till plötslig hjärtdöd, är ett exempel på deterministiskt spatiotemporalt kaos, och utvecklade och experimentellt verifierade en mekanism för att förhindra VF.

Hans forskningsintressen inkluderar elektrofysiologi av celler och vävnader som modelleras matematiskt, analys av experimentella och kliniska arytmidata med tekniker för olinjär dynamik, samt forskning och utveckling av farmakologiska och elektrofysiologiska terapier för att förhindra eller reglera arytmier. Han studerar också rollen av fysiologiska och patofysiologiska svängningar i biologiska system, med särskilt fokus på mekanismerna för deras skapelse och förstörelse, och skapandet av normala och patologiska mönster i biologiska system.

Han började sin karriär som professor i vetenskapsfilosofi vid California State University, Northridge. När han flyttade till University of California, Los Angeles, hade han en rad befattningar som ledde till professor i medicin (kardiologi) och integrativ biologi och fysiologi (2003–2018), där han för närvarande är forskningsprofessor och professor emeritus. 2019–2020 var han Newton Abraham gästprofessor vid institutionen för datavetenskap och Lincoln College, University of Oxford.

Pris och ära

Garfinkel har mottagit utmärkelser inklusive Astor Visiting Lecturer, University of Oxford, UCLA University Distinguished Teaching Award (2015) och många andra. Hans text "Modellerliv" belönades med Textbook Excellence Award från Textbook and Academic Authors Association. Hans patent inkluderar "Realtidsstabiliseringssystem för pulserande aktivitet" (US5447520A).

Böcker

  • Modeling Life: The Mathematics of Biological Systems.
  • Förklaringsformer: Att tänka om frågorna i socialteori.

Publikationer

  • Alan Garfinkel, Mark L Spano, William L Ditto, James N Weiss. Att kontrollera hjärtkaos. Vetenskap.
  • Alan Garfinkel, Young-Hoon Kim, Olga Voroshilovsky, Zhilin Qu, Jong R Kil, Moon- Hyoung Lee, Hrayr S Karagueuzian, James N Weiss, Peng-Sheng Chen. Förebyggande av ventrikelflimmer genom att platta ut hjärtrestitution. Proceedings of the National Academy of Sciences.
  • Alan Garfinkel, Peng-Sheng Chen, Donald O Walter, Hrayr S Karagueuzian, Boris Kogan, Steven J Evans, Mikhail Karpoukhin, Chun Hwang, Takumi Uchida, Masamichi Gotoh, Obi Nwasokwa, Philip Sager, James N Weiss. Kvasiperiodicitet och kaos vid hjärtflimmer. Journal of Clinical Investigation.
  • Alan Garfinkel, Yin Tintut, Danny Petrasek, Kristina Boström, Linda L Demer. Mönsterbildning av vaskulära mesenkymala celler. Proceedings of the National Academy of Sciences.
  • Yina Guo, Ting-Hsuan Chen, Xingjuan Zeng, David Warburton, Kristina I. Boström, Chih-Ming Ho, Xin Zhao och Alan Garfinkel. Förgreningsmönster uppstår i en matematisk modell av lungutvecklingens dynamik. Journal of Physiology.
  • Lingyun (Ivy) Xiong och Alan Garfinkel. En vanlig väg till cancer: Onkogena mutationer avskaffar p53-svängningar. Framsteg inom biofysik och molekylärbiologi.

externa länkar