APPL1

APPL1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, APPL, DIP13alpha, MODY14, adapterprotein, fosfotyrosin som interagerar med PH-domän och leucinblixtlås 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Adapterprotein, fosfotyrosin som interagerar med PH-domän och leucin zipper 1 (APPL1), eller DCC-interagerande protein 13-alpha (DIP13alpha), är ett protein som hos människor kodas av APPL1 - genen . APPL1 innehåller flera viktiga interaktoriska domäner: pleckstrin homologi (PH) domän , fosfotyrosinbindande (PTB) domän och Bin–Amphiphysin–Rvs (BAR) domän.

Fungera

APPL1 är ett adapterprotein lokaliserat till en undergrupp av Rab5-positiva ("tidiga") endosomer , där det rekryterar andra bindningspartners och reglerar vesikelhandel och endosomal signalering . APPL1 anrikas vid mycket tidiga endosomer som är negativa för EEA1 , vilket indikerar att APPL1 påverkar de tidigaste stadierna av endosomal trafik innan EEA1 tar över. Detta är i linje med observationer att APPL1 och EEA1 konkurrerar om Rab5-bindning. APPL1 påverkar internaliseringshastigheten av nyckelendosomala laster (t.ex. EGF-receptor ) som är beroende av Rab5-aktivering.

PTB-domänen av APPL1 reglerar många cellsignaleringshändelser i specifika endosomala avdelningar - ibland kallade "signalerande endosomer". Detta inkluderar lysofosfatidinsyra (LPA)-inducerad signalering (tillsammans med interagerande protein GIPC1 ). Ytterligare roller för APPL1 fastställdes till kärnan där APPL1 kan lokaliseras en gång dissocierad från endosomer.

Mutantstudier

Musmutantalleler för Appl1
Markörsymbol för musgen. Denna symbol tilldelas det genomiska lokuset av MGI	Appl.1
Muterade mus embryonala stamcellkloner. Dessa är de kända riktade mutationerna för denna gen i en mus.	Appl1 tm1a(KOMP)Wtsi
Exempelstruktur av riktad villkorad mutant allel för denna gen
Dessa mutanta ES-celler kan studeras direkt eller användas för att generera möss med denna gen utslagen. Studie av dessa möss kan kasta ljus över funktionen hos Appl1: se Knockout-mus

Interaktioner

APPL1 har visats interagera med Deleted in Colorectal Cancer , AKT2 , men även Rab5, Rab21 , OCRL och nästan 30 andra proteiner.

Vidare läsning

•   Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (juni 2002). "Konstruktion av expressionsfärdiga cDNA-kloner för KIAA-gener: manuell kuration av 330 KIAA-cDNA-kloner" . DNA-forskning . 9 (3): 99–106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
•   Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (februari 2000). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. XVI. De kompletta sekvenserna av 150 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
•   Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (juli 2002). "Medling av DCC-apoptotiska signalen genom DIP13 alfa" . Journal of Biological Chemistry . 277 (29): 26281–5. doi : 10.1074/jbc.M204679200 . PMID 12011067 .
•   Yang L, Lin HK, Altuwaijri S, Xie S, Wang L, Chang C (maj 2003). "APPL undertrycker androgenreceptortransaktivering genom att förstärka Akt-aktivitet" . Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 16820–7. doi : 10.1074/jbc.M213163200 . PMID 12621049 .
•    Miaczynska M, Christoforidis S, Giner A, Shevchenko A, Uttenweiler-Joseph S, Habermann B, Wilm M, Parton RG, Zerial M (februari 2004). "APPL-proteiner länkar Rab5 till nukleär signaltransduktion via ett endosomalt fack" . Cell . 116 (3): 445–56. doi : 10.1016/S0092-8674(04)00117-5 . PMID 15016378 . S2CID 18281503 .
•   Nechamen CA, Thomas RM, Cohen BD, Acevedo G, Poulikakos PI, Testa JR, Dias JA (augusti 2004). "Humant follikelstimulerande hormon (FSH)-receptor interagerar med adapterproteinet APPL1 i HEK 293-celler: potentiell involvering av PI3K-vägen i FSH-signalering" . Reproduktionens biologi . 71 (2): 629–36. doi : 10.1095/biolreprod.103.025833 . PMID 15070827 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (augusti 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•   Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (november 2004). "Fosfoproteomisk analys av den utvecklande mushjärnan" . Molekylär och cellulär proteomik . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktober 2005). "Mot en proteomskalakarta över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•    Mao X, Kikani CK, Riojas RA, Langlais P, Wang L, Ramos FJ, Fang Q, Christ-Roberts CY, Hong JY, Kim RY, Liu F, Dong LQ (maj 2006). "APPL1 binder till adiponektinreceptorer och förmedlar signalering och funktion av adiponektin". Naturens cellbiologi . 8 (5): 516–23. doi : 10.1038/ncb1404 . PMID 16622416 . S2CID 21273764 .
•   Cheng KK, Lam KS, Wang Y, Huang Y, Carling D, Wu D, Wong C, Xu A (maj 2007). "Adiponektin-inducerad endotelial kväveoxidsyntasaktivering och kväveoxidproduktion medieras av APPL1 i endotelceller" . Diabetes . 56 (5): 1387–94. doi : 10.2337/db06-1580 . PMID 17287464 .
•   Li J, Mao X, Dong LQ, Liu F, Tong L (maj 2007). "Kristallstrukturer av BAR-PH- och PTB-domänerna av humant APPL1" . Struktur . 15 (5): 525–33. doi : 10.1016/j.str.2007.03.011 . PMID 17502098 .
•    Zhu G, Chen J, Liu J, Brunzelle JS, Huang B, Wakeham N, Terzyan S, Li X, Rao Z, Li G, Zhang XC (juli 2007). "Struktur av APPL1 BAR-PH-domänen och karakterisering av dess interaktion med Rab5" . EMBO Journal . 26 (14): 3484–93. doi : 10.1038/sj.emboj.7601771 . PMC 1933402 . PMID 17581628 .
•   Saito T, Jones CC, Huang S, tjeckisk MP, Pilch PF (november 2007). "Interaktionen mellan Akt och APPL1 krävs för insulinstimulerad Glut4-translokation" . Journal of Biological Chemistry . 282 (44): 32280–7. doi : 10.1074/jbc.M704150200 . PMID 17848569 .

externa länkar

• Mänskligt APPL1- genomplacering och APPL1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .