Inom molekylärbiologi är BAR-domäner mycket konserverade proteindimeriseringsdomäner som förekommer i många proteiner involverade i membrandynamik i en cell. BAR-domänen är bananformad och binder till membranet via sin konkava yta. Den kan känna av membrankrökning genom att företrädesvis binda till krökta membran. BAR-domäner är uppkallade efter tre proteiner som de finns i: Bin, Amphiphysin och Rvs.
BAR-domäner förekommer i kombination med andra domäner
Många proteiner i BAR-familjen innehåller alternativa lipidspecificitetsdomäner som hjälper till att rikta dessa proteiner till särskilda membranavdelningar. Vissa har också SH3-domäner som binder till dynamin och därför är proteiner som amfifysin och endofilin inblandade i orkestreringen av vesikelklyvning.
N-BAR-domän
Vissa BAR-domäninnehållande proteiner har en N-terminal amfipatisk helix som föregår BAR-domänen. Denna helix infogas (som i epsin ENTH-domänen) i membranet och inducerar krökning, som stabiliseras av BAR-dimeren. Amfifysin, endofilin, BRAP1/bin2 och nadrin är exempel på sådana proteiner som innehåller en N-BAR . Drosophila amphiphysin N-BAR (DA-N-BAR) är ett exempel på ett protein med en preferens för negativt laddade ytor.
F-BAR-domäner (för FCH-BAR, eller EFC för Extended FCH Homology) är BAR-domäner som är förlängningar av den redan etablerade FCH-domänen. De finns ofta vid aminoterminalen av proteiner. De kan binda lipidmembran och kan tubulera lipider in vitro och in vivo, men deras exakta fysiologiska roll är fortfarande under utredning. Exempel på F-BAR-domänfamiljen är CIP4/FBP17/Toca-1, Syndapins (även kallade PACSINs) och muniscins . Gen-knock-out av syndapin I hos möss avslöjade att denna hjärnanrikade isoform av syndapinfamiljen är avgörande för korrekt storlekskontroll av synaptiska vesiklar och hjälper därmed verkligen till att definiera membrankrökningen en fysiologisk process . Arbete från Britta Qualmanns labb visade också att syndapin I är avgörande för korrekt inriktning av den stora GTPase- dynaminen till membran.
Sortera nexins
Den sorterande nexinfamiljen av proteiner inkluderar flera medlemmar som har en BAR-domän, inklusive den välkaraktäriserade SNX1 och SNX9 .
