2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxi-3-cyklohexen-1-karboxylsyrasyntas
| 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxi-3-cyklohexen-1-karboxylsyrasyntas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Den här bilden visar de två kedjorna som går samman för att utgöra detta enzym
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| EG nr. | 2.2.1.9 | ||||||||
| CAS-nr. | 122007-88-9 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är SEPHCHC-syntas ( EC EC 2.2.1.9 ), som kodas av menD-genen i E. coli , ett enzym som katalyserar det andra steget i biosyntesen av menakinon (vitamin K2). De två substraten för detta enzym är 2-oxoglutarat och isokorismat. Produkterna av detta enzym är 5-enolpyruvoyl-6-hydroxi-2-succinyl-cyklohex-3-en-1-karboxylat och CO2 . Den tillhör transferasfamiljen.
Klassificering
Detta enzym tillhör en familj av enzymer som överför aldehyd- eller ketongrupper . För att vara specifik tillhör detta enzym transketolas och transaldolas. Vanliga namn för enzymet är:
- Laga
- SEPHCHC-syntas
- 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxi-3-cyklohexen-1-karboxylsyrasyntas
- Systematiskt namn: isokorismat:2-oxoglutarat 4-oxopentanoattransferas
Reaktion
I biosyntesen av vitamin K är SEPHCHC involverad i det andra steget av vägen. Typen av reaktion är dekarboxylerande, och för att ha maximal aktivitet använder detta enzym kofaktorn Mg2+, en magnesiumjon. Tidigare år trodde man att denna reaktion ledde till SHCHC, produkten MenH . Efter ytterligare forskning vet vi nu att denna reaktion är ett nytt steg på vägen. Den faktiska produkten av detta enzym kan förlora ett pyruvat spontant.
Strukturera
Strukturerna avslöjar en stabil dimer-av-dimer-association i överensstämmelse med gelfiltrering och analytiska studier bekräftar klassificeringen av MenD i pyruvatoxidasfamiljen. Den aktiva platsen är mycket basisk med en hydrofob lapp. Dessa egenskaper matchar de kemiska egenskaperna hos substraten.
Homologer
Det finns många liknande strukturer MenD. Även om det är vanligt förekommande i E. Coli , men kan också hittas i andra organismer. Bacillus subtilis och Mycobacterium tuberculosis är två homologer. Alla organismer har något gemensamt, att de katalyserar dekarboxyleringsreaktioner.
