Yttre membranutflödesproteiner
| Identifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| av yttre membranutflödesprotein | |||||||||
 | |||||||||
| Symbol | OEP | ||||||||
| Pfam | PF02321 | ||||||||
| InterPro | IPR003423 | ||||||||
| SCOP2 | 1ek9 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.17 | ||||||||
| OPM superfamilj | 34 | ||||||||
| OPM-protein | 1yc9 | ||||||||
| |||||||||
Proteiner i den yttre membranutflödesproteinfamiljen bildar trimera (tredelade) kanaler som tillåter export av en mängd olika substrat i gramnegativa bakterier . Varje medlem i denna familj består av två upprepningar. Den trimeriska kanalen består av en 12-strängad beta-pipa som sträcker sig över det yttre membranet och en lång helt spiralformad cylinder som sträcker sig över periplasman .
Exempel inkluderar Escherichia coli TolC yttre membranprotein, som krävs för korrekt uttryck av yttre membranproteingener; Rhizobium nodulationsproteinet; och Pseudomonas FusA-proteinet, som är involverat i resistens mot fusarinsyra .
- Johnson JM, Church GM (april 1999). "Inriktning och strukturförutsägelse av divergerande proteinfamiljer: periplasmatiska och yttre membranproteiner från bakteriella utflödespumpar". Journal of Molecular Biology . 287 (3): 695–715. CiteSeerX 10.1.1.73.559 . doi : 10.1006/jmbi.1999.2630 . PMID 10092468 .