Yip1-domänfamilj
Yip1 -domänfamiljen är en grupp proteiner som är involverade i reglering av sekretorisk trafik i eukaryoter . Familjen består av fyra medlemmar i jäst och nio medlemmar i människor. Familjemedlemmar har en delad arkitektur som innehåller fem transmembrandomäner .
Evolution
Yip1-domänfamiljemedlemmar finns i alla eukaryoter. Den spirande jästen Saccharomyces cerevisiae har fyra Yip1-domänfamiljemedlemmar: Yif1p, Yip1p, Yip4p och Yip5p. Aminosyrasekvensen för Yip-domänfamiljens medlemmar delar upp dem i två grupper, kallade α-subenheter och β-subenheter. α-subenheterna – i jäst Yip1p och Yip4p – är närmare besläktade med varandra än de är till β-subenheterna, Yip5p och Yif1p. Hos däggdjur är båda grupperna expanderade, med a-subenheter YipF4, YipF5, YipF6 och YipF7; såväl som p-subenheter Yif1A , Yif1B, YipF1, YipF2 och YipF3.
Fungera
Yip1-domänfamiljemedlemmar lokaliserar sig till Golgi-apparaten, där de interagerar med varandra för att bilda komplex som är involverade i handel med last inom Golgi och/eller mellan det endoplasmatiska retikulumet och Golgi. Familjemedlemmarna i Yip1-domänen är spridda över hela kroppen – med undantag för YipF7 som främst finns i skelettmuskulaturen och tungan , medan YipF1A huvudsakligen finns i levern . Inom cellen har de olika Yip-familjemedlemmarna något olika lokaliseringar, med YipF5, YipF7, Yif1A och Yif1B (i jäst Yip1p och Yif1p) vid marginalen av det endoplasmatiska retikulumet och Golgi; YipF3 och YipF4 vid cis-Golgi ; och YipFl, YipF2 och Yipf6 (i jäst Yip4p och Yip5p) vid trans-Golgi .
YipF1 slogs villkorligt ut i möss utan någon observerbar effekt.
En icke-funktionell version av YipF6 förvärrade tarminflammation hos möss och resulterade ibland i spontan tarminflammatorisk sjukdom.
Strukturera
Varje Yip1-domänfamiljprotein innehåller fem transmembrandomäner, med N-terminalen exponerad för cytosolen och C-terminalen för Golgi-apparatens lumen. Yip1-domänfamiljemedlemmar tros interagera med en partner, med två molekyler av varje partner som bildar ett aktivt tetramerkomplex med 20 transmembransegment.